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推进神秘水的描述以改善药物设计

2019-01-11 15:39:06 • 来源：

与水的相互作用决定了药物分子如何与靶标结合，但是对这些相互作用建模很困难，限制了药物设计的准确性。在AIP出版社的“化学物理学报”最近的一篇论文中，来自加州理工学院的William A. Goddard III和Saber Naserifar描述了他们建立水的新描述的新方法(称为力场)并展示了它准确性。

推进神秘水的描述以改善药物设计

化学和应用物理学教授戈达德对结果感到“惊讶”。“我们得到的描述几乎适合所有水的属性，令人难以置信的准确，远远优于以往任何力场，”他说。

量子力学只能准确描述小型系统，因此我们对液态水的理解依赖于使用力场的模拟。尽管经过数十年的努力，目前的力场并未同时描述水的所有属性。“一个力场可能会给出正确的密度和水的蒸发，但可能与熔点相差100度，”戈达德说。“这听起来很糟糕，但这都是我们所拥有的。”

这些不完整的模型限制了药物设计，限制了我们对工业溶剂反应的理解，促使科学家们研究了一些水的异常特征。例如，有人提出，当水过冷到低温时，它可能同时存在高密度和低密度液体，如果有足够的水力场可以理解得更好。

与以前的力场不同，戈达德和Naserifar专注于模拟水的个体相互作用。工作“向后”，他们首先考虑长距离相互作用，然后增加电荷和极化动力学。戈达德说：“以前的力场不允许收费，这是一个重要的进步。” 此外，对于强氢键，该团队利用最近发布的，高度准确的水二聚体计算。

“我们单独使用高质量的量子力学来进行每次相互作用 - 远程，短程，氢键，极化 - 将它们放在一起，进行测试，发现它非常准确，”戈达德说。“预测0.2开尔文内液体的熔点......这是闻所未闻的!”

他们的新力场仅在一个属性上失败：计算粒子扩散的速度或扩散常数。Goddard和Naserifar对这种不规则性感到“困惑”，但仍对他们的力场取得的成就感到兴奋。他们热衷于用它来研究水的异常性质，看看它是否能提高药物设计的准确性。

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