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对濒临灭绝的kakapo的基因组进行测序

一个由基因测序科学家组成的国际团队,包括杜克大学的一些科学家, 想要对所有活着的kakapo - 一种极度濒危的新西兰不会飞的鹦鹉 - 的基因组进行测序 - 而世界上仍然有125只。这是第一个旨在对特定物种的每个成员进行排序的项目。科学家及其合作者希望公众能够通过群众资助来帮助他们。他们希望筹集45,000美元美元,而且还有一半多一点。仅剩2个半月,你可以帮助写下这个故事的结尾。

对濒临灭绝的kakapo的基因组进行测序

四年前,杜克研究专家杰森·霍华德从图书馆拿起一本儿童读物给他6岁的女儿读书。它是关于kakapo(Strigops habroptilus),一种不会飞的,夜间鹦鹉,闻起来像蜂蜜。

霍华德在霍华德休斯医学研究员的神经生物学家埃里希贾维斯的杜克医学实验室工作,他正在共同领导一项大规模的持续努力,对所有10,000种鸟类的基因组进行测序。所以,霍华德的图书馆书籍选择并不是随机的。(事实上​​,他当时对鹦鹉基因组进行了测序。)

但是,当霍华德读到关于拯救这个心爱的人群和快速老化的鸟类的努力时,他问他的女儿是否认为他应该把卡卡波的基因组作为优先事项。(她说,“是的,爸爸,做吧!”)霍华德能够从卡卡波获得DNA样本,这本身就是一项壮举,并获得了序列的草稿。“但三年前的测序技术并没有那么好,而且价格昂贵得多,”他说。

他想获得更高质量的基因组并研究个体的基因组,部分原因是因为剩下的kakapo很少。因为这只鸟是最古老的鹦鹉种类之一,它也可以让贾维斯的实验室更好地理解声乐学习和语音模仿的演变,他们的许多研究都集中在这里。

即使在过去的一年中,基因组测序的进展已经回应了该组希望更详细的kakapo基因组的愿望。贾维斯的实验室完成了一个名叫简的卡卡波的基因组; 他们所谓的“参考”基因组将允许他们更简单,更便宜地拼凑其他个体kakapo的序列。他们只需要资金来做更多事情。幸运的是,分子生态学家Bruce Robertson,奥塔哥大学的副教授,新西兰保护部的Andrew Digby和遗传救援基金会的David Iorns接近霍华德,当时他正在研究Jane的基因组,关于资助并众包一个项目,以序列所有剩余的kakapo。霍华德说:“我从未梦想过全力以赴。”

从20世纪80年代开始的保护工作已经采用了育种策略来促进人口减少,但是随着个体基因组的掌握,该小组将能够了解哪些kakapo具有对特定疾病的遗传易感性,并且能够更有效地培育它们以产生更多的后代。强大的免疫系统。(有一天,科学家甚至可以使用基因编辑技术修改易受疾病影响的基因。)基因组还可以让他们研究这些鸟类中低生育力的任何遗传原因,这些原因只能间歇性地交配。

卡卡波目前居住在新西兰两个小岛屿的野外,因为人类引进的捕食者,包括猫和狗,都是在大陆上运行的。

Kakapo Recovery可以从已经灭绝的地区获取死亡鸟类的博物馆样本,包括近200年前的一些。如果该项目资金充足,他们可以利用这些博物馆标本,以更好地了解各种岛屿种群和可能的死亡线索。

截至2月15日,该团队的众筹工作已达到150多名支持者,但他们希望看到更多的捐款。要了解有关kakapo的更多信息,请查看Kakapo恢复和遗传救援基金会。

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