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破译进化生物学的新工具

2019-06-23 15:19:30 • 来源：

理解进化是生物学的基石之一 - 事实上，进化是生命在地球上多样性的唯一解释。基于蛋白质的进化，研究人员可以通过遗传变化解释新物种和功能的出现，如何设计具有新功能的酶，或者例如人类如何与其最亲近的亲属如大猩猩或倭黑猩猩相关。

进化研究的一种流行方法是使用计算机辅助生物信息学工具比较基因组数据。使用这些方法的科学家可以比较特定的蛋白质，这些蛋白质由20种通用构建块组成，称为氨基酸。用于研究单个蛋白质进化的生物信息学工具假设蛋白质不同区域进化的速度可以用统计分布建模，其形状由单个变量确定。

“然而，这种假设并不反映现实，它可能导致大部分有偏见的系统发育结果在过去二十年左右发表，”来自综合生物信息学中心(CIBIV)的Minh Quang Bui解释说。该研究的共同作者。

一种新算法可以深入了解蛋白质的进化

Max F. Perutz实验室(MFPL)组长Arndt von Haeseler和澳大利亚国立大学的Lars Jermiin现在已经找到了一种革命性的方法，可以将不同的进化速率实施到生物信息学模型中。

专家们都知道，流行的方法可能无法捕捉蛋白质进化的复杂性。然而，使用更逼真的模型的计算成本高得令人无法接受。“我们现在开发了一种快速算法，使我们以前无法深入了解蛋白质进化 - 新工具可能会对各种研究领域产生巨大影响，包括病原体的进化和农业害虫的传播，”杰米敏说。

新计划ModelFinder将允许对进化过程进行更准确的科学估计。这种对进化的更深入理解将有助于我们更接近地揭开神秘面纱，这些神秘事物对我们星球上的巨大多样性负有责任。

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