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基因组测序取代了标准耐药性测试

2019-07-16 14:02:05 • 来源：

来自CRyPTIC联盟的国际研究团队在抗击结核病方面取得了重要进展：对10,000多种病原体菌株进行的大规模基因组分析表明，基因组测序可以改善结核病治疗。此外，该方法有可能取代时间密集的表型抗性测试。这项由牛津大学领导的研究结果发表在最新一期的“ 新英格兰医学杂志”上。

基因组测序取代了标准耐药性测试

结核病(TB)是世界上最致命的传染病。根据世界卫生组织(WHO)的最新报告，去年约有1000万人感染结核病，160万人死于感染后果。

结核病治疗的一个主要问题是多药耐药菌株(MDR-TB)的发生率增加，这些菌株对常用药物不再敏感。及时诊断耐药性对治疗成功至关重要。经典抗性测试涉及在含有抗生素的培养基中培养细菌，目前需要数周时间。此外，这些测试并未在结核病发病率高的许多国家使用。因此，许多患者采用错误的药物组合，随后治愈和生存的机会较低。迫切需要更快速和实用的电阻测试方法。

CRyPTIC研究检查了来自16个国家的10,000多个细菌基因组。Leibniz肺中心研究中心Borstel(FZB)捐赠了来自德国，非洲和中亚的600多种TB菌株的数据，并参与了数据评估。

该研究也于2018年9月26日在纽约举行的联合国大会结核病高级别会议上发表，该研究表明，病原体基因组的变化可用于非常准确地预测对标准一线药物的耐药性。基因组测序可以精确和单独地确定所需的药物组合，并节省标准抗性测试中使用的资源。FZB研究人员还致力于在中亚和非洲的参考实验室建立基因组分析。

“这项研究数据为结核病诊断学开发了新的概念。另外，常用药物的标准耐药性测试很快就会被基于基因组的方法所取代。这是一个里程碑，也是抗击耐多药结核病的范式转变，” FZB的CRyPTIC研究负责人，德国感染研究中心(DZIF)结核病研究领域的协调员Stefan Niemann说。

在英格兰，荷兰和纽约沃兹沃思公共卫生中心，结果已经导致细菌培养物用于抗性测试的减少以及完全基于基因组测序结果的治疗开始。在德国，Robert Koch研究所和FZB目前正在筹划一项试点研究，以评估基因组测序在诊断和监测方面的全国适用性。

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