在癌细胞中挖掘基因组的最暗部分可产生黄金

玛格丽特公主的科学家们从丰富的未知基因组或癌细胞遗传物质的领域挖掘出了黄金：这是开发抗前列腺癌药物的新蛋白质靶标。

使用最先进的全基因组测序技术对前列腺肿瘤样品进行研究，玛格丽特公主癌症中心的研究人员专注于经常被忽视的基因组非编码区：大量无基因的DNA(即不编码的DNA)蛋白质)，但仍然具有决定基因是否开启或关闭的重要调控因素。

以前被认为是“垃圾” DNA，非编码区曾经被认为对治疗癌症几乎没有作用。

但这从未阻止玛格丽特公主癌症中心的高级科学家Mathieu Lupien博士将他的研究计划投入到非编码基因组的研究中。

我们正在探索未知领域。我们的目标是战胜癌症。我们必须到处寻找包括隐藏的“金”在内的癌细胞基因组的“最暗”部分。”

多伦多大学医学生物物理系副教授Mathieu Lupien博士，其实验室的口号是“通过表观遗传学解码癌症”。

Lupien 博士和一个由21位成员组成的研究小组于2019年11月14日星期四在《癌症细胞》(Cancer Cell)上发表了他的最新论文，题为“ Cistrome-partitioning揭示了原发性前列腺肿瘤中主转录调节剂的体细胞突变和风险变体的融合” 。国家和国际临床医生，科学家，病理学家和计算科学家评估了在原发性前列腺肿瘤中发现的270,000多种突变的作用。

他们发现，它们在特定的非编码区中积累，这些非编码区由一组特定的蛋白质组成，这些蛋白质控制基因的开启/关闭状态。抑制这些蛋白质(Lupien博士称之为“细胞大师”)可阻止前列腺癌细胞的生长，显示出它们对药物开发的价值。

这代表了一种新方法，可从编码和非编码来源的肿瘤中发现的所有突变中获取丰富的信息。他解释说，它使我们能够确定治疗目标的优先级。

想象一下非编码基因组开放的可能性。”

理解非编码基因组或黑暗基因组是科学家日益关注的领域。

2003年，人类基因组计划对人类基因组进行了地图绘制和测序，该基因组由人类成长所需的所有基因组成。

研究发现，大约21,000种蛋白质编码基因仅占我们整个基因组的2%，即生命蓝图或人类基因手册。

而其他98%的基因组-非编码(蛋白质)部分-发挥什么作用?

科学家们已经意识到，隐藏在这种非编码DNA中的是至关重要的元素，这些元素不仅控制着数千个基因的活性，而且在许多疾病中也起着重要作用。开采该区域可为潜在的治疗方法提供重要的测序线索。

Lupien博士说，人类基因组非常复杂。他解释说，基因组的黑暗或尚未发现的部分包含数百万个基因开关，影响了我们生命中各个阶段的人体所有细胞。

“现在，我们可以开始将这些遗传开关与癌症发展联系起来，以更准确地了解疾病的开始方式和治疗方法。”

Lupien博士补充说，精确医学目前依赖于数百种生物标志物-药物组合，如果我们想实现精确医学的希望，就需要扩大生物标志物和药物的清单。

“将非编码基因组纳入我们的分析是实现我们目标的正确方向上的飞跃。”