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研究人员组装欧亚鲈鱼基因组

2018-11-16 19:58:55 • 来源：互联网

n G3最近发表在《科学杂志》上的一项研究:基因、基因组,遗传学,爱沙尼亚生命科学大学的研究人员与图尔库大学的同事们合作,欧亚鲈鱼基因组组装。三次小于人类基因组,但包含大约10亿个核苷酸和超过23000个基因。调查鲈鱼源自湖的黑暗水域Loosalu Rapla县的沼泽中。研究的结果使世界各地的科学家们更好地理解自然选择的影响。

研究人员组装欧亚鲈鱼基因组

欧亚鲈鱼是一种很常见的鱼类在爱沙尼亚和欧亚大陆。其栖息地范围从俄罗斯远东地区的不列颠群岛。这个物种可以在极端环境条件下生存并成功地繁殖。因此,栖息在贫营养湖泊水上,波罗的海的微咸水和酸性黑暗的水沼泽湖泊其他鱼类无法生存。然而,它还不知道什么遗传机制帮助上适应这种不同的生活条件。

鲈鱼是一个重要的链接在水体的食物链。此外,条纹鱼有巨大影响甲烷循环的湖泊,湖泊几乎10倍的甲烷排放量减少改变食物链。由于甲烷是一种比二氧化碳更有效的温室气体,鲈鱼的扮演着一个重要的角色在减少全球变暖。“这是特别重要的是理解为什么栖息在沼泽湖泊的适应机制缺乏氧气(富含腐殖质物质),甲烷排放是最高和鲈鱼的往往是唯一的鱼类,”鱼类学家反Vasemagi说,瑞典农业科学大学的教授、高级研究员爱沙尼亚生命科学大学领导这项研究。

根据Vasemagi,组装基因组是一个重要的里程碑。“与以前研究的鱼类相比,高价值的基因组,我们用创新的方法基于单独的长的DNA分子标记和确定的序列短,“Vasemagi说。

科学家说,应用方法允许快速基因组测序更大,相对便宜,准确地说,在极其困难的任务匹配的基因组分为数以百万计的小游戏。因此,它终于可以覆盖整个基因组进行研究不同的鱼类。Vasemagi补充说,最简单的方法用于抓住基因组的大小将其测量人类可以理解的。“如果你想象一个碱基对是1毫米的长度,鲈鱼基因组可以达到从塔尔图到柏林,”他说,补充说,研究小组的下一个任务是绘制基因组区域,或公里路线从塔尔图到柏林,包含自然选择的痕迹。

更重要的是,鲈鱼是一个重要的商业利用鱼类和休闲渔民中也是一个非常受欢迎的目标。在欧洲广泛养殖在很多地方。鲈鱼基因组的测序”使科学家们绘制的基因组区域,影响鱼类的生长速率,达到性成熟,抵抗疾病,和其他重要的水产养殖特点,“总值Riho教授说,爱沙尼亚大学水产养殖的椅子上生命科学。“鲈鱼基因组的测序将简化类似的研究在北美,我们栖息的近亲,黄色的鲈鱼(拉丁名如蛾)是广泛的。基因组测序鲈鱼只是第一步理解进化机制有了栖息最成功的和广泛的鱼类在欧亚大陆温带,”Vasemagi总结道。

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