香蕉基因组测序

一个由植物科学家组成的国际联盟已经完成了香蕉基因组的第一次测序。

发现香蕉基因组含有超过36,000个基因，略高于人类基因组。结果发表在Nature杂志上。

“我们正在处理大量信息，”共同作者，亚利桑那大学植物科学学院助理教授Eric Lyons博士说。“植物基因组具有令人难以置信的动态，这使它们成为最令人着迷的同时也是最难研究的生物体。”

在许多品种的香蕉中，其学名是Musa acuminata，一种名为DH-Pahang的品种因其对疾病的易感性而闻名，使其成为一种糟糕的作物选择。DH-Pahang在农业产业的支持下，由两家法国研究机构CIRAD和CEA-Genoscope领导的测序团队为该项目选择了该品种，从而成为明星。

DH-Pahang香蕉与其亲属的不同之处在于它具有遗传学家所谓的纯合基因组。

“这意味着每个染色体的两个拷贝都是相同的，”Lyons博士解释说。“使用纯合子基因组可以更容易地解决基因组的拼图并正确地组装所有部分。你不会因为基因组中的基因等位基因具有略微不同的拼图或序列而感到困惑。“

根据该财团的说法，香蕉对南方国家4亿多人的食物和经济安全至关重要，但它们受到一系列寄生虫的持续压力。生产我们在超市中发现的“出口”香蕉的种植园的压力特别大。这使得开发新的，更具抗性的品种变得至关重要，尽管由于栽培香蕉品种的肥力非常低，这是一项复杂的操作。

新近获得的基因组序列提供了对植物每个基因及其11个染色体上的位置的访问。该联合会在一份声明中表示，这种知识将使识别负责抗病性和果实品质等性状的基因变得更加容易。最后，它将成为利用全世界许多遗传资源改善香蕉品种的重要工具。

香蕉是其植物类中的第一种非草生植物，即单子叶植物，其整个基因组已被测序。Monocots包括草，棕榈，百合和其他多数肉质的植物。另一方面，Dicots包含更多进化的近期植物，包括大多数开花植物和所有真树。

“香蕉是我们测序的第一个单子叶植物基因组，它不是来自谷物，”里昂博士说。“这给了我们一个很好的机会来将这个群体与其远亲进行比较，并更好地了解单子叶植物谱系的演变。”

研究人员已经能够确定香蕉已经发现了三次完整的基因组重复事件，其中至少有两次与草中的情况无关。与动物王国不同，复制整个基因组在植物世界中并不罕见。

“我们有时会开玩笑说，一旦你给植物一个有趣的外观，它就会使整个基因组翻倍，”里昂斯博士说。

这种被称为多倍体的现象是植物基因组对像Lyons博士这样的科学家提出挑战的主要原因之一，Lyons博士有兴趣了解基因组如何在进化时间内发生变化并将其与生物体的功能联系起来。

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