中国基因网您的位置：首页 >基因科普 >

新研究为鸭嘴兽种群结构和历史提供了见解

2018-12-14 21:47:13 • 来源：

该鸭嘴兽(鸭嘴兽anatinus)是卵生哺乳动物，其中，沿着针鼹，占据哺乳动物家族的一个独特的地方。这种独特的生物在十年前进行了基因组测序，揭示了其独特的基因组成及其与1.6亿年前其他哺乳动物的分歧。现在，通过对来自昆士兰州，新南威尔士州和塔斯马尼亚州的57种鸭嘴兽进行的第一次全尺寸基因组测序，可以更加了解其生态和种群历史。

这种人口规模的鸭嘴兽全基因组测序研究是非人类哺乳动物最大的此类研究之一，也是非胎盘哺乳动物的第一项研究。

研究共同主要作者，惠康人类遗传学中心和统计学系的Peter Donnelly博士说：“我们的分析提供了对该物种的种群结构和多样性水平的深入了解，并且无法估计个体之间的相关性。”在英国牛津大学。

“例如，我们发现超过一半的样本在从同一条河流采样的其他个体中至少有三度亲属。此外，还有26对二级或三级亲属，在所有情况下来自同一条河流或小溪，或紧密相连的水道，涉及57个样本中的28个。“

Donnelly博士及其同事能够估计其工作中的重要进化力量，包括鸭嘴兽突变率，分歧时间和整个历史中的种群大小。

“我们估计了鸭嘴兽的新生突变率，这是非胎盘哺乳动物的首次估计，”研究第一作者，同样来自牛津大学的Hilary Martin博士说。

“我们发现它是哺乳动物的中间道路，低于人类和黑猩猩，但高于实验室育成的老鼠。”

“点估计的相对排序与观察结果一致，即哺乳动物的突变率与体重和发生时间呈负相关。”

该研究还估计，鸭嘴兽种群最有可能在近一百万年前共同拥有一个共同的祖先。

“人口树上最深的分支分为三个独立的群体：塔斯马尼亚岛(澳大利亚南部的一个岛屿，大约12000年前与大陆分离)的样本;来自昆士兰北部(远北)的人;其余样本来自昆士兰州中部和新南威尔士州，“澳大利亚悉尼大学的共同主要作者Jaime Gongora博士说。

“我们认为最有可能的是，有三个祖先种群(塔斯马尼亚，北昆士兰和新南威尔士州北部/昆士兰中部)大约在同一时间，大约80万年前聚集在一起。”

“昆士兰中部的样本可能与大约30万年前的新南威尔士北部样本共享一个祖先的人口。这意味着在很长一段时间内澳大利亚的鸭嘴兽样本中存在广泛的种群结构。“

“有趣的是，我们估计的分歧时间早于鸭嘴兽最早的化石证据，”唐纳利博士说。

“这一发现并不一定与化石证据相矛盾，但表明现代鸭嘴兽可以追溯到上新世早期到中期。这可能与它从巨型鸭嘴兽物种Obdurodon tharalkooschild进化而来。

此外，该团队还发现了过去人口瓶颈的证据，特别是在大约1万年前的北昆士兰州，并确定了现代人口(特别是在加拿芬河附近)，这将得到保护工作的帮助。

昆士兰州的瓶颈可能反映了北方(澳大利亚湿热带)和中央昆士兰之间适合的鸭嘴兽栖息地的历史和当前的孤立和缺乏，被称为“伯德金河间隙”(以伯德金河命名)。

“这个炎热干燥的地区目前气候不适合鸭嘴兽，长期以来一直是基因交换的障碍，”贡戈拉博士说。

该研究发表在“分子生物学与进化”杂志上。

郑重声明：本文版权归原作者所有，转载文章仅为传播更多信息之目的，如有侵权行为，请第一时间联系我们修改或删除，多谢。

推荐内容