来自癌症基因组图谱(TCGA)研究网络的研究人员的一对研究为致命类型的大脑和皮肤癌的基因组工作提供了新的见解。研究结果指出了基于基因组学对癌症进行分类的新方法，这将导致更明智的方法来预测疾病行为和更好的治疗决策。

黑色素瘤是最严重且可能致命的皮肤癌形式，近年来发生了复兴。新型免疫疗法 - 启动人体免疫系统的治疗方法 - 加入了大量针对特定遗传目标的新药。更常见的靶标之一，BRAF基因的突变，在多达一半的黑素瘤中发挥作用。

在一项研究中，来自50多个机构和超过5个国家的TCGA研究人员分析了333个黑色素瘤皮肤肿瘤的基因组，确定了可能有助于临床医生确定哪些肿瘤更具攻击性以及哪些肿瘤更可能对某些治疗有反应的分子亚型。由休斯顿德克萨斯大学MD安德森综合癌症中心的Lynda Chin医学博士，医学博士Jeffrey Gershenwald和Ian Watson博士领导的研究人员于6月18日在Cell上报道了他们的研究结果。

在该论文中，研究人员报告说，皮肤或皮肤黑色素瘤可以分为四种亚型之一，这四种亚型基于基因突变：BRAF突变体，RAS突变体，NF1突变体和Triple-WT(野生型)。这种基因组分类应该有助于更好地个性化患者的治疗。例如，Triple-WT肿瘤亚型的特征在于称为受体酪氨酸激酶的生长促进酶的突变，其可能被抑制其活性的药物治疗。

TCGA研究人员还发现了一些他们不一定期望的东西：一组患者 - 他们的黑色素瘤肿瘤中的免疫细胞基因活性高于正​​常，并且在其他地方传播 - 活得更长。研究结果表明，一些黑色素瘤患者的可能结局和治疗可能受到肿瘤中发现的免疫细胞类型和活性水平的影响。

“这可能对免疫疗法产生影响，免疫疗法一直是黑色素瘤的改变者，是发病率增长最快的癌症之一，”沃森博士说。“我们看到这种免疫系统基因活性在黑色素瘤亚型中均匀分布。随着靶向治疗，这将为个性化治疗决策提供信息。”

“免疫活动的观察是该论文的一个亮点，具有潜在的临床应用，”现在德克萨斯大学奥斯汀分校系统的Chin博士说。“我们看到了一些黑色素瘤患者的免疫检查点抑制剂的显着临床反应，这些患者的疾病已在其他地方传播。这一结果让人怀疑具有高免疫活性的患者是否会对这类疗法做出反应。” 检查点抑制剂是释放免疫系统以攻击肿瘤的药物。然而，她指出，该研究并未提供证据证明此类免疫活性的存在可预测对检查点治疗的反应。

对神秘脑肿瘤的新见解

在6月10日在新英格兰医学杂志(NEJM)上发表的脑肿瘤报告中，一个由300多名TCGA研究人员组成的研究小组揭示了观察罕见且通常致命的脑癌(称为低级别胶质瘤(LGG))的新方法。

研究人员确定脑肿瘤基于其基因构成更好地定义，从而绘制出更清晰的癌症图像，而不是病理学家只是在显微镜下观察。他们设计了一种有前途的新方法来帮助预测疾病可能如何进展以及哪些治疗可能最有效。这些发现可以迅速改变这些癌症的诊断和治疗方式，并且出人意料地可以帮助对抗最严重的神经胶质瘤。

每年约有23,000名美国人患上脑癌，导致约14,000人死亡。胶质瘤约占脑癌的三分之一。较低级别的胶质瘤是最难治疗的脑癌之一，部分原因是它们难以诊断。

科学家传统上将LGG分为三组肿瘤 - 星形细胞瘤，少突胶质细胞瘤和少突细胞瘤 - 尽管在显微镜下研究肿瘤组织的病理学家经常得到模棱两可的结果。

科学家们确定了三种新的肿瘤分子分类，每种分类都有不同的临床表现。肿瘤类别包括具有IDH基因突变，TP53基因或称为1p / 19q共缺失的染色体异常的那些。

使用肿瘤的基因组构成指导治疗并不新鲜，但这是科学家第一次将这种方法扩展到脑肿瘤。研究人员知道，携带IDH1或IDH2基因突变的LGG(构成大多数成人LGG病例)和1p / 19q共同缺失的突变在治疗中表现良好。但他们惊讶地发现，缺乏突变的IDH野生型(wt)之一的分子群具有攻击性，并且具有典型的多形性胶质母细胞瘤(GBM)的分子改变，这是一种更危险和更高等级的癌症类型。研究人员建议使用IDHwt 可能是GBM的前体，这可能对治疗和新的临床试验产生影响。

新的分类可以使临床医生将基因组数据与来自组织病理学的证据相结合，以预测疾病进程并提供更完整的诊断和风险评估，以及更好的治疗选择和改进的试验设计。

“现在，一种少突神经胶质瘤不仅可以根据显微镜下的样子进行分类，还可以为诊断提供分子基础，”主要作者，埃默里大学医学院医学博士，医学博士Daniel Brat说。亚特兰大。“这是通过分子改变开始定义肿瘤的重要一步。它可能会改变实践。”

两个团队都意识到他们的研究工作是了解癌症行为方式的漫长而艰巨的过程的一部分，并且有时在逐个人的基础上开发出对抗癌症的方法。TCGA的力量在于它能够识别模式并试图理解癌症的分子疯狂。

TCGA和通过该计划资助的研究团队于2008年启动，揭示了许多不同肿瘤类型的基因组细节，如结肠癌，乳腺癌，卵巢癌和肾癌。TCGA是由国家癌症研究所和国家人类基因组研究所共同支持和管理的合作，这两个研究所都是美国国立卫生研究院的两个部分。