在CRISPR摸索的地方Argonaut可以找到一个句柄

尽管可以对CRISPR系统进行编程以运行各种DNA编辑游戏，但这些游戏有时会以错误结束，这取决于基因组栅格的哪些部分被定位。在一些基因组区域，缺乏原型间隔区相邻基序(PAM)意味着CRISPR必然会失去其控制力。有时，CRISPR最好保持观望。然而，替代基因组编辑系统可以进入基因组编辑游戏。该系统基于蛋白质Argonaut，甚至可以在DNA编辑手册中添加新页面。

在普渡大学，由农业和生物工程助理教授Kevin Solomon博士领导的研究人员创建了一种基因组编辑方法，该方法使用来自Natronobacterium gregoryi(NgAgo)的Argonaut。研究人员报告说，NgAgo可能提供DNA作为指导，可以修改任何基因组位置，为潜在改善制造，疾病治疗，药物发现和作物生产提供新的选择。

研究人员于4月4日在佛罗里达州奥兰多举行的美国化学学会全国会议上描述了他们的方法。在他们的演讲中，研究人员解释说他们的方法可以克服让Argonaut留在替补席上的问题。基本上，所有目前表征的pAgos都是嗜热的，使得它们不能用于常见的嗜温模型生物。然而，Purdue团队一直在研究一种嗜温pAgo，这种pAgo显示出作为基因组编辑工具的前景。

“计算结构模型显示，我们的pAgo候选物包括在其他催化活性pAgos中发现的经典N末端，PAZ，MID和PIWI结构域，例如可编程限制酶PfAgo，”研究人员在摘要中指出了它们的发表。“然而，我们的嗜温蛋白还含有推定的单链DNA结合或repA结构域。”

repA结构域，pAgos的系统发育分析揭示，是文献中目前未被认识的一类新的嗜温pAgos的特征。

“我们的pAgo候选人在体外试验中没有指导的情况下非特异性地切割和切割质粒DNA，可能是由于存在与蛋白质共同纯化的单链DNA，”摘要继续说。“截短和取代突变体表明这种切割可以独立地归因于repA和PIWI结构域。在体内，我们能够用5'-磷酸化的DNA指导编程我们的pAgo候选物，切割质粒和染色体靶标，以降低大肠杆菌在选择条件下的存活率。“

无论靶基因功能如何，研究人员都观察到这种效应据研究人员称，这一发现表明，致死性是由于未修复的双链DNA断裂所致。“在存在同源供体DNA和pAgo的情况下，”他们强调，“同源重组在靶基因位点增加了50%，这表明基因编辑应用是可行的。”

“虽然仍有工作要做，但我们已经证明这些分子剪刀可以编辑以前现有技术无法进入的DNA区域，”负责该项目的硕士生Michael Mechikoff说。

“我最好的朋友之一死于几年前由遗传变异引起的癌症，”在所罗门实验室的研究小组工作的博士生Kok Zhi Lee补充道。“我一直梦想着为我的朋友设计一个不同的场景 - 生活在一个基因工程是纠正遗传性疾病的常规和安全选择的时代。凭借我们技术的潜力，我预计遗传病将成为人类历史的未来。“

该团队与普渡大学研究基金会技术商业化办公室合作，提交了该技术的实用专利。他们正在寻找合作伙伴和其他有兴趣开发和许可它的人。

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