蛋白质序列比对中的顺序是否重要

如果您执行添加的顺序很重要，并且'2 + 3 + 4'的总和给出了'4 + 3 + 2'总和的不同答案怎么办?各地的会计师都会因为他们的书籍不再平衡而哭泣。您可能会发现自己在超市停下来，想知道您是否可以通过在牙膏前购买牛奶来省钱。欧洲电视网的球迷可能会在投票后的早些时候重视“投球积分”。

幸运的是，没有新的证据表明订单是重要的。然而，UCD的研究人员最近发现，顺序对于序列比对来说是一个令人惊讶的数量，这是现代遗传分析的重要组成部分。序列比对用于理解在不同物种中发现的蛋白质之间的相似性和差异。蛋白质是生命的基石，在细胞中发挥着大部分功能。因此，了解蛋白质及其功能是生物学的关键部分。

我们可以使用成对序列比对来确定特定蛋白质的哪一部分在一对物种(例如人类和黑猩猩)之间是相同的。使用多序列比对，我们可以识别在所有哺乳动物或甚至更大的物种组中保守的蛋白质部分。

非常大的序列比对有助于我们了解蛋白质的哪些部分是重要的; 如果蛋白质的一部分在所有哺乳动物中是相同的那么它可能是重要的，并且还使我们对蛋白质的三维结构有一些了解(因为在3D空间中靠近在一起的蛋白质的部分倾向于在物种间一起变化)。

爱尔兰UCD康威研究所和系统生物学博士生Kieran Boyce，Fabian Sieviers博士和Des Higgins教授发现，对于大蛋白质序列比对，序列比较的顺序很重要，即从序列比对程序中得到的比对取决于您将序列输入程序的顺序。

这一发现令人惊讶，因为人们已经进行了数十年的序列比对，却不知道结果对输入顺序的依赖程度。这很重要，因为它表明大多数利用大型多序列比对的科学出版物可能没有提供足够的信息来重现其结果。

再现性是科学的重要组成部分。因此，在进行序列比对时，大多数科学家将提供序列比对程序及其使用的设置的详细信息。Boyce等人的研究结果表明，顺序也是一个重要的设置，可能需要从现在开始提供。本文留下的问题是我们如何使序列比对程序忽略顺序，或者我们如何选择最佳可能的顺序。

郑重声明：本文版权归原作者所有，转载文章仅为传播更多信息之目的，如有侵权行为，请第一时间联系我们修改或删除，多谢。

人世间周秉昆最后结局是什么为什么坐牢？人世间周蓉最后结局和谁