设计融合蛋白药物的更好方法

在A * STAR开发的新软件可以帮助科学家设计复杂的生物制药药物，这些药物需要将蛋白质结合在一起。该工具可在线免费获取，允许研究人员和药物开发人员输入所需的蛋白质片段，并相应地选择最佳“接头”。

领导平台开发商Dong-Yup Lee，A * STAR生物加工技术研究所(BTI)和新加坡国立大学的化学工程师表示，他“非常愿意与其他研究人员合作，特别是来自生物制药公司，他们正在寻找适合其合成融合蛋白药物的接头。“

Lee和他的同事在Bioinformatics期刊中描述了该软件。

合适的肽接头的选择可能是复杂的，并且在抗体和其他涉及连接两种不同蛋白质的复杂药物或生物技术工具的设计中经常被忽略。然而，如果使用不合适的接头，附着的蛋白质可能无法正确折叠。它们也可能表达水平较低，或活动受损。

为了改进连接子选择过程，Lee和他的同事开发了一个名为SynLinker的基于网络的平台，该平台包含2,150个天然肽接头和另外110个人工或经验连接子的数据库。用户可以通过接头长度，氨基酸组成，溶解度和影响接头灵活性和功能的其他特征来搜索SynLinker。从多个候选接头中挑选后，用户可以使用每个接头对其所需的融合蛋白构建体进行建模。“预测融合蛋白的可能构象是SynLinker的一个独特特征，”Lee说。

Lee的团队使用SynLinker为融合酶选择合适的接头，使科学家能够在实验室模型生物中研究人体药物代谢。Lee解释说，他和他的同事们正在酵母菌株中表达这些融合系统，他们“目前正在通过与BTI微生物组合作进行功能测试的实验验证。”

类似的生物信息学工具已经存在，但现在已经停止。名为LINKER的一个不再在线，另一个称为LinkerDB，不再被更新或改进。SynLinker对生物医学研究界非常重要，因为它提供了同类最新，最全面的资源。“SynLinker是唯一可用于在合成融合蛋白设计中选择接头候选物的最新在线资源，”Lee说。

SynLinker可在线免费获取。“我们还提供在线帮助信息和教程视频，以指导用户使用SynLinker，”Lee说。

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