寻找海底总动员的基因

一个国际研究团队绘制了Nemo的基因组图谱，为研究界提供了宝贵的资源，可以解码鱼类对环境变化(包括气候变化)的反应。

在由阿卜杜拉国王科技大学(KAUST)和ARC珊瑚礁研究卓越中心(Coral CoE)领导的突破性研究中，研究人员使用高科技测序工具为其创建了一个最完整的遗传图谱。橙色小丑鱼，一个普通的礁石居民和迪斯尼电影的明星，海底总动员。

“该基因组提供了理解珊瑚鱼生物学各个方面的基本蓝图，”主要作者，沙特阿拉伯KAUST的Robert Lehmann博士说。

“它包含26,597个蛋白质编码基因。就像世界上最大的拼图游戏一样，需要耐心和时间来组装。”

橙色小丑鱼Amphiprion percula不仅是地球上最受认可的珊瑚鱼，也是研究最多的鱼类之一。

“该物种对珊瑚鱼的生态，环境和进化方面的突破性研究至关重要，”共同作者，澳大利亚詹姆斯库克大学Coral CoE教授Philip Munday说。

“例如，小丑鱼是研究鱼类性别变化的模型。它还帮助我们了解珊瑚鱼中幼虫传播的模式，它是第一个被证明可以通过海洋酸化损害捕食者避免行为的鱼类。 “。

该团队使用最先进的技术对小丑鱼的基因组进行测序。他们的基因组和转录组数据现在可通过http://nemogenome.org上的Nemo Genome DB数据库获得。

“小丑鱼需要大约9.39亿个核苷酸需要配合在一起，”KAUST的共同作者Timothy Ravasi教授说。

“这对于研究界来说是非常宝贵的资源，并将进一步建立橙色小丑鱼作为遗传学和基因组研究的理想实验室主题。”

“这是有史以来最完整的鱼类基因组之一，”詹姆斯库克大学Coral CoE的共同作者David Miller教授说。

“使用PacBio单分子，实时测序技术，使我们能够获得优异的结果。”

文章“寻找海底总动员的基因：组织小丑鱼基因组的染色体尺度参考组装，Amhiprion percula”今天发表在分子生态学资源杂志上。

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