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生命科学如何处理它如何处理基因组信息的山脉

2019-07-08 08:45:18 • 来源：

基因测序技术在过去的几十年中取得了突飞猛进的发展。但是，随着基因组学家和参与研究项目的其他人产生大量的DNA，RNA或蛋白质组学数据，他们很清楚，存储和分析所有这些信息正在迅速成为一个棘手的问题。

在最近的一篇文章中纽约时报突出的困难，列举多家领先的研究播出他们的挫折与测序和数据处理技术之间创新的步伐不一致。“数据处理现在已成为瓶颈，”加州大学圣克鲁兹分校生物分子科学与工程中心主任大卫·豪斯勒告诉“ 纽约时报”。“分析基因组比分析基因组需要花费更多。”

实际上，尽管预计整个人类基因组测序的价格将在未来几年内降至预期的1000美元大关，但这种成本与存储和分析基因组数据的费用相比相形见绌。

和海量数据(其中科学家覆盖在其10月份发行)也可能会导致设计存储信息库联邦的模板。据“ 泰晤士报”报道，仅在过去的一年中，存储在一个这样的数据库中的数据量增加了两倍以上，在300万亿个含氮碱基的接缝处膨胀，占据了近700万亿字节的计算机内存。

太平洋西北国家实验室的生物学家Steven Wiley告诉“ 纽约时报”说：“我们拥有这些巨大的数据，无法连接它们。” “我坐在我们过去一年半一直试图分析的一堆数据前面。”

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