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大麦基因组测序

寻找更好的啤酒或单一麦芽苏格兰威士忌?加州大学河滨分校的一组研究人员可能会为您提供帮助。他们是全球77位科学家中的一员,他们对大麦的全基因组进行了测序,这是啤酒和单一麦芽苏格兰威士忌的关键成分。这项研究,正在制作10年,刚刚发表在“ 自然 ”杂志上。“这使得大麦 基因组的完整性水平上升了很多,” 加州大学河滨分校遗传学教授Timothy Close说。“这使得研究大麦的研究人员更容易专注于可实现的目标,从新的品种开发到育种再到基因的机械研究。”

大麦基因组测序

该研究还将帮助那些与其他“谷类作物”合作的科学家,包括大米,小麦,黑麦,玉米,小米,高粱,燕麦甚至草坪草,它们和其他粮食作物一样,都在草丛中,Close说。

大麦已作为主食和发酵饮料以及动物饲料使用了一万多年。

它存在于早餐谷物和通用面粉中,有助于面包上升。麦芽啤酒赋予啤酒颜色,身体,蛋白质以形成良好的头部,以及发酵所需的天然糖。单一麦芽苏格兰威士忌仅由水和麦芽制成。

“ 自然”杂志上的报告提供了对麦芽制作过程至关重要的基因家族的新见解。大麦基因组序列还能够鉴定在驯化期间易受遗传瓶颈影响的基因组区域,这些知识有助于指导育种者在其作物改良工作中优化遗传多样性。

十年前,由德国莱布尼茨植物遗传与作物植物研究所的Nils Stein领导的国际大麦基因组测序协会开始组装一个完整的大麦基因组参考序列。

这是一项艰巨的任务,因为大麦基因组的大小几乎是人类基因组的两倍,其中80%由高度重复的序列组成,如果没有相当大的额外努力,这些序列无法准确地分配到基因组中的特定位置。

本文使用多种新策略来规避这种基本限制。测序技术,算法设计和计算方面的重大进步使其成为可能。尽管如此,这项工作仍然使世界各地的团队 - 包括德国,澳大利亚,中国,捷克共和国,丹麦,芬兰,瑞典,瑞士,英国和美国 - 占据了十年。这项工作提供了超过39,000个大麦基因的知识。

自石器时代以来,酒精饮料一直是由发芽的大麦制成的,有些人甚至认为这是人类采用植物栽培的一个主要原因,至少在大麦被驯化的肥沃新月中。

在发芽过程中,淀粉酶蛋白由发芽的种子产生,以分解储存在干燥谷物中的富含能量的淀粉,产生单糖。然后这些糖可用于酵母发酵以产生醇。基因组序列显示出比编码淀粉酶的基因预期的更多变异性。

大麦种植在世界各地,俄罗斯,德国,法国,加拿大和西班牙是最大的生产国之一。在美国,大麦主要生长在西北部。爱达荷州,蒙大拿州和北达科他州是主要的生产国。

在大自然纸被称为“染色体构象捕获命令序列大麦基因组。”

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