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小RNA与新合成的转录物相互作用以沉默染色质

FMI的Yukiko Shimada,Fabio Mohn和MarcBühler阐明了小RNA介导的染色质沉默的重要机制细节。他们在裂殖酵母中发现RNA诱导的沉默复合物(RISC)中的小RNA与新生转录物相互作用而不是与互补DNA相互作用以诱导异染色质形成。此外,转录率和转录物处理都对沉默过程有影响。

小RNA与新合成的转录物相互作用以沉默染色质

关于小RNA以及它们如何调节染色质状态和转录基因沉默已经有很多了解。然而,一个重要的机制方面是不可能研究的:携带小RNA的蛋白质复合物如何与染色质相互作用以沉默基因。它是通过小RNA与DNA的相互作用吗?它是通过小RNA与新形成的转录本的相互作用吗?还是有其他因素涉及?

弗里德里希·米歇尔生物医学研究所(FMI)高级组长MarcBühler评论道:“这是一个让我困惑十多年的根本问题”,但我们从未有过适当的工具来解决这个问题。

当他的小组实验室经理Yukiko Shimada意识到缺乏功能性RNA聚合酶相关因子1复合物(Paf1C)的裂殖酵母突变体使他们能够正确地解决这个问题时,布勒非常激动。

在随后的项目中,最近在Genes and Development中发表,Shimada表明转录超过一定的阈值是RNA指导的异染色质形成所必需的。一系列优雅的实验表明,RNA诱导的沉默复合物(RISC)中含有Argonaute的小RNA必须与新合成的RNA转录物相互作用。然后,这种相互作用导致异染色质形成,从而导致相应DNA序列的沉默。然而,当转录速率超过一定水平时,相互作用 - 并且因此异染色质形成 - 受到阻碍。“有一个与转录率相关的沉默机会之窗,”布勒解释道。

Shimada进一步表明RNA加工对小RNA介导的异染色质形成有影响。在称为剪接的过程中,RNA转录物被进一步分开并重新排列。不除编码蛋白质的序列,即所谓的内含子。这是一个在转录发生时开始的连续过程。在目标位于快速剪接的转录物开始处的内含子序列的情况下,异染色质形成是双稳态的。Bühler解释说:“在这些情况下,我们观察到两种情况,然后目标基因座保持常染或完全沉默。”

最后,结果显示小RNA与互补的新转录的RNA相互作用而不是DNA。总的来说,该研究为非编码RNA定向表观遗传基因沉默的新生转录本模型提供了长期寻求的直接证据,并为小RNA的设计提供了见解,这些小RNA应该在多细胞生物中诱导染色质沉默。

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