中国基因网

中国基因网您的位置：首页 >国内研究 >

直接从患者研究疟疾转录组学

2019-02-16 09:31:22 • 来源：

推进疟疾研究的一个关键障碍一直是体外培养寄生虫的困难。值得庆幸的是，在20世纪70年代，研究人员做了一些重要的发现，使他们能够持续培养疟疾寄生虫恶性疟原虫(Plasmodium falciparum)的最致病菌株，从而获得有助于预防数百万新感染的重要发现。然而，由于科学家无法培养最广泛的疟疾寄生虫间日疟原虫(Plasmodium v​​ivax)，因此仍然存在困难。然而，现在，马里兰大学医学院(UMSOM)基因组科学研究所(IGS)的研究人员已经开发出一种基因组序列的新方法，用于研究和更好地了解间日疟原虫的传播。

直接从患者研究疟疾转录组学

每年有超过800万例临床疟疾由间日疟原虫引起，研究人员必须更好地处理使这种寄生菌株在全球普遍存在的分子机制。在这方面，IGS研究人员与柬埔寨巴斯德研究所的研究人员合作，分析来自间日疟原虫疟疾患者的寄生虫基因表达谱，以确定氯喹作为疟疾治疗的有效性。他们使用基因组学和生物信息学方法的组合，比较了来自不同患者感染的寄生虫转录组或核糖核酸(RNA)分子组，并分析了寄生虫如何对氯喹(一种常见的抗疟药)产生反应。

这项新研究的结果最近在Nature Communications上发表，文章标题为“ 间日疟原虫转录组显示阶段特异性氯喹反应和雄性和雌性配子体的差异调节 ”。

“通过直接从受感染的患者血液样本中分析寄生虫mRNA，我们能够观察到并非所有感染都含有感染蚊子和传播疾病所需的雄性和雌性寄生虫的相同比例，”高级研究调查员David Serre解释说。 ，博士，微生物学和免疫学副教授，IGS成员。“这一观察结果表明寄生虫传播比我们之前想象的更复杂，也许寄生虫能够改变其发育以确保最佳生存。”

研究人员分析了氯喹治疗引起的基因表达变化，并证明这种抗疟药物虽然有效地消除了间日疟原虫寄生虫，但其作用与对恶性疟原虫寄生虫的作用不同。“这强调了这两种人类疟疾寄生虫之间的生物学差异，以及如果我们希望最终消除全球疟疾，那么具体研究这种重要病原体的重要性，”Sere指出。

“我们对来自26名疟疾患者的间日疟原虫寄生虫的转录组进行了表征。我们发现大多数寄生虫mRNA来自滋养体，因此间日疟原虫感染的异步性不太可能混淆基因表达研究，“作者补充说。“配子体基因的分析揭示了两个不同的共调节基因簇，表明雄性和雌性配子体是独立调节的。最后，我们分析了由氯喹诱导的基因表达变化，并表明这种抗疟药有效地消除了大多数间日疟原虫寄生虫阶段，但与恶性疟原虫不同，它不影响滋养体。

基因组测序研究为这种被忽视的人类寄生虫提供了独特的见解，但仅限于识别DNA序列中编码的生物学差异。然而，基因表达研究可以提供关于寄生虫生命周期的调节及其对药物的反应的信息，由于每个患者感染中存在寄生虫阶段的异质混合物，因此对于该病原体实施具有挑战性。

“这项重要的研究将有助于我们更好地了解如何治疗，预防并最终消除这种疟疾，”UMSOM医学博士，院长兼大学医学事务副总裁E. Albert Reece总结道，他并非直接参与研究。“随着对抗疟疾药物耐药性的日益关注，这一点尤其重要。”

郑重声明：本文版权归原作者所有，转载文章仅为传播更多信息之目的，如有侵权行为，请第一时间联系我们修改或删除，多谢。

推荐内容