美国能源部联合基因组研究所(DOE JGI)和环境分子科学实验室(EMSL)已经接受了2017年提交的10个项目，这些项目旨在为他们的联合“用户科学合作设施”(FICUS)倡议提出建议。

这些新的研究项目都涉及由美国能源部生物和环境研究办公室管理的两个用户设施之间的协作，并整合专业知识和能力，以解决支持能源部能源，环境和基础研究任务的紧迫问题。FICUS计划为科学家提供了一个独特的机会，可以在一个提议的研究项目中利用基因组学和分子鉴定的综合力量。研究人员的项目由外部评审员选择，他们将获得两个用户设施的能力，以生成这两个关键基础设施提供商独有的数据集 - 获得超出任何一个设施本身可能产生的收益。

接受的提案将于2016年10月1日开始，属于以下重点主题领域：植物 - 微生物相互作用，生物燃料和生物产品，以及精选无机物的生物地球化学。

一些项目侧重于各种生态系统中土壤微生物群落的响应：

马萨诸塞大学阿默斯特分校的杰弗里布兰查德及其同事旨在确定哪些代谢过程在土壤群落中对温度升高有活性，哪些微生物是通过活性生物群的重水标记增加二氧化碳通量的原因。土壤微生物群落如何应对气候变化可以改变土壤从碳汇到碳源的作用。了解土壤群落在自然环境中的生态功能对于生态系统建模至关重要。

俄亥俄州立大学的弗吉尼亚里奇对北部永久冻土的预期融化的影响很感兴趣。使用经过深入研究的永久冻土融化的“模式生态系统”，她和她的同事们打算研究解冻永久冻土带来的碳损失途径，以及调节碳通量的泥炭地微生物群落的代谢变化。

俄亥俄州立大学的Kelly Wrighton对温度变暖如何让更多的灌木在北极生长感兴趣，这导致浓缩的单宁和其他分子的增加，这些分子可以抑制碳的微生物降解。为了更多地了解这些分子对区域生态系统中发现的土壤和反刍动物微生物群落的影响，她和她的团队旨在使用阿拉斯加柳树重建模型浓缩单宁路径，可用于测试相关的北极微生物群落。

涉及土壤群落的两个项目侧重于涉及针叶树和生态菌根真菌的相互作用：

捷克共和国科学院的Petr Baldrian正在研究针叶林中的土壤和叶凋落物微生物，以了解有关碳循环相关过程中氮可用性的更多信息。通过代谢组学分析，研究人员希望找出微生物功能季节性变化的驱动因素 - 树根内外 - 以及树根与其共生真菌之间的相互作用。此外，通过DOE JGI的1000真菌基因组计划获得的真菌基因组预计将提供生态学观点。

杜克大学的慧玲辽属研究针叶树和外生菌根之间的共生互动粘盖在根和根际土壤中发现的真菌。该团队旨在更好地确定这些物种在土壤养分周转中的作用。

其他项目侧重于沿海海洋环境：

佛罗里达大学的Tom Bianchi对一种被称为“启动效应”的现象感兴趣，这种现象在土壤中得到了很好的研究，但在海洋环境中却很难理解。沿佛罗里达州的海岸线有红树林，盐沼和海草，它们捕获“蓝碳”或来自海岸和海洋环境的有机碳。实验室实验表明，在高反应性底物存在下，溶解的有机碳在最初的24小时内分解速度提高了75倍。该团队的一个问题是启动效应如何影响受海平面上升和湿地相应损失影响的蓝碳储存。

华盛顿大学的Rose Ann Cattolico对藻类Chrysochromulina tobin及其10个成员的细菌生物群系感兴趣，其中8个已​​经测序。该团队旨在了解这个藻类细菌联盟在碳固定和氮处理过程中的作用，以及海洋盐度的变化如何影响这个藻类细菌联盟的代谢相互作用。

两个项目的重点是从生物质生产生物燃料：

俄克拉荷马大学的Laura Bartley对草中的次生细胞壁发育很感兴趣。虽然草细胞壁是生物燃料生产中最丰富的潜在生物质来源之一，但是破坏细胞壁的过程限制了可用于转化为糖的生物质。

加州大学伯克利分校的Jeffrey Skerker想要了解生物质衍生的碳如何在酵母Rhodosporidium toruloides中转化为脂质和萜类化合物，以及如何在这种生物体中调节碳通量。通过系统生物学水平研究，他的团队旨在将R. toruloides开发成一种新型代谢工程平台生物，可将生物质衍生产品转化为生物燃料和生物产品。

一个项目专注于生物地球化学：

斯坦福大学的Scott Fendorf对地下水中污染物的持久性感兴趣。他的研究小组专注于科罗拉多河流域，遗留污染使洪泛平原留有铀痕迹，他的团队旨在了解洪泛平原沉积物中有机物分解的代谢限制，以及碳循环的这种调节如何影响金属循环。