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噬菌体是具有双链DNA基因组的小型病毒

2019-12-25 10:56:36 • 来源：

噬菌体是具有双链DNA基因组的小型病毒，与巨型病毒共同感染真核细胞。几乎所有已知的噬菌体基因组仅共享四个共同的基因：主要和次要衣壳蛋白(分别为MCP和mCP)，参与DNA包装的ATPase和参与衣壳成熟的半胱氨酸蛋白酶PRO。

噬菌体是具有双链DNA基因组的小型病毒

美国能源部(DOE)联合基因组研究所(JGI)，美国能源部科学办公室的研究人员最近在微生物组中进行了报道，他们通过计算方法将已知的高质量噬菌体基因组序列的数量增加了10倍。通过在JGI的整合微生物基因组和微生物组(IMG / M)数据套件(包括IMG / VR(用于病毒)中)中提取超过14,000个公共宏基因组数据集，以用于噬菌体标记基因MCP，他们能够识别出44,221个总噬菌体部分序列，包括超过28,000个唯一的MCP序列。

进一步的分析导致鉴定了包含所有四个核心基因的328个“高质量”(基于完整性)多样化的新病毒噬菌体基因组。这些噬菌体存在于不同的生境中，包括空气，植物根际，废水，甚至是动物和人类(首次)肠道，并且在分类学上分为27个不同的进化枝(其中17个没有先前已知的代表)。其中，有89个重叠群被认为是完整的基因组，它们的发现将可能的噬菌体基因组大小范围从13.8-29.3千碱基(Kb)扩展到10.9-42.3 Kb。此外，基因计数也从13-25上升到12-39。研究小组总结说：“总体而言，我们对病毒体的多样性，分布和进化进行了全球分析。”

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