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基因可以揭示我们的来源

2018-12-06 14:30:17 • 来源：

研究人员已经制作了一种生物地理算法，该算法利用遗传信息可靠地推断出一个人的原籍国。由英国谢菲尔德大学的Eran Elhaik领导的国际研究团队，包括贝鲁特黎巴嫩美国大学的Pierre Zalloua，对超过1,650名患者的样本测试了地理人口结构(GPS)算法。以前是基因分型。

该算法在Nature Communications中提出，准确地将83%的个人放在他们的原籍国内，并将一些人精确定位到他们的城市。

基因可以揭示我们的来源

研究人员将GPS与空间祖先分析(SPA)进行了比较，该算法于2012年在Nature Genetics上发表。只适用于欧洲血统已知的人。Elhaik解释说，这首先击败了该工具的目的。包含一个非欧洲人将使整个队列的预测准确度降至零。

“相比之下，全球定位系统使用的是固定参考人口面板并且与样本无关。单独分析样本或与10,000个其他样本分析样本总会产生相同的结果，”Elhaik补充道。

“如果研究的目的是了解空间遗传变异的模式，那么SPA将更有用，”SPA算法的共同作者Eleazar Eskin说。“另一方面，GPS是一种专门用于预测个体位置的方法。如果可以获得具有已知位置的高精度参考样本，那么GPS将更准确。”

“全球定位系统的新颖性在于实现群体遗传学的新范例，其中所有种群都被认为是混合的，因此可以用混合系数来表示，而不像其他工具模拟群体作为两种群体的混合物，”Elhaik说。

创建该算法以精确定位个体的位置;但是当谈到混合社区时;它在跟踪他们的祖先方面比在精确定位新鲜迁移和现今居住方面更精确。Elhaik建议，17%没有妥善安置在他们的祖国，可能是因为他们的迁徙历史。

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