研究人员确定了数百种影响肿瘤基因表达的编码基因之外的突变

科学家首次将位于编码基因外部的突变与肿瘤基因表达的变化联系起来，以帮助开发未来的诊断和治疗策略。

癌症由于不受控制的细胞生长和分裂而发展，最终导致癌细胞在体内的转移扩散，从而引起大器官功能障碍。

开拓性研究表明，向癌细胞的转化是由细胞DNA中突变的积累驱动的。

研究人员阐明了基因中特定突变的影响，并发现这些突变在癌症的特征中起着不可或缺的作用。这项研究导致了当今临床上许多成功的治疗方法的开发。

但是，在癌细胞中发现的绝大多数突变都在基因之外的DNA序列中找到，这些序列称为非编码区。这些突变对询问具有更强的抵抗力。

来自加州大学圣地亚哥分校的研究人员在非编码区鉴定出数百种突变，这些突变直接调节与癌症有关的基因的表达。他们的工作发表在《自然遗传学》杂志上。

“大多数癌症相关的突变发生在基因的基因组以外的地区，但也有如此令人难以置信的许多人说，很难知道这实际上是相关的，这仅仅是噪音，说：”资深作者特雷·艾迪克博士，教授摩尔癌症中心和加州大学圣地亚哥分校医学院。

人们已经尝试使用The Cancer Genome Atlas(TCGA)来理解非编码突变的影响，TCGA是NIH建立的来自正常组织和肿瘤的基因组测序数据存储库。但是，这些努力仅确定了一种相关的非编码突变。

爱德克和他的合作者成功地利用了TCGA数据，增加了额外的分析层，而其他人则无法做到。

艾德克说：“秘诀在于寻找基因表达的变化。”

他补充说：“这是我们首次在癌症中起作用的非编码DNA中发现了约200个突变，这比我们以前知道的多199个。”

该团队通过对这些功能性非编码突变对癌细胞系的影响进行建模，验证了他们的发现。

他们发现，这些突变直接影响着驱动癌症特征的基因的表达，包括肿瘤细胞的入侵。

艾德克(Ideker)实验室的博士后研究员，第一作者魏章说：“一个突出的例子是影响DAAM1基因的非编码突变。”

“ DAAM1的激活使肿瘤细胞更具侵略性，并且能够更好地侵袭周围组织。”

他们的工作可能有助于开发新颖的诊断和治疗策略，这些策略依赖于确定患者肿瘤中的功能突变。

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