美国马里兰州贝塞斯达， 2018年10月12日 - 美国国立卫生研究院支持的计划正在确定哪些基因和基因组变异在人类疾病中发挥作用，使其能够用于基因组医学和研究。美国国立卫生研究院的临床基因组资源(ClinGen)和ClinVar计划解决了将基因组医学纳入医疗保健的一个主要障碍，这是缺乏基因变异与疾病之间关系的证据。10月12 日发表的一篇关于人类突变的特刊突出了通过这些计划取得的广泛进展，这些计划协同工作以推进将人类基因组变异与人类健康联系起来的知识。

国家人类基因组研究所(NHGRI)于2013年在Eunice Kennedy Shriver 国家儿童健康与人类发展研究所和国家癌症研究所的支持下建立了ClinGen 。ClinGen的目标是汇集临床和研究专家，以开发标准流程，以审查基因变异及其与健康和疾病的关系的数据。然后，这些专家确定每种变体对疾病诊断和治疗的意义。有关基因变异的信息存储在ClinVar中，由美国国立卫生研究院的国家生物技术信息中心(国家医学图书馆的一部分)资助和维护。

“通过ClinGen和ClinVar的工作，来自230个机构的730多名研究人员，临床医生和策展人一直在共同努力，以标准化与人类疾病有关的基因和基因组变异的评估，”Eric Green博士说道，他是博士， NHGRI主任。“最终，这些努力将改善基因组医学的实施和更高质量的患者护理。”

提供证据

ClinGen研究人员开发了基因 - 疾病有效性框架，以评估基因变异在特定疾病中的作用。由来自世界各地的癌症，神经发育障碍和心血管疾病等疾病专家组成的临床医生和研究人员组成的14个基因治疗专家小组正在实施这一框架。在特刊中，两个专家小组报告了与癫痫和RAS病相关的基因; 后者是一组罕见的遗传病，包括Noonan综合征，Cardio-Facio-Cutaneous综合征，Costello综合征和Legius综合征。癫痫的16个基因中的8个以及评估其对RAS病变的贡献的20个基因中的6个没有足够的证据支持疾病中的作用。

ClinGen的研究人员还利用美国医学遗传学和基因组学学会以及分子病理学协会开发的指南来确定基因中导致疾病的那些特定变异和那些不导致疾病的变异。在四篇发表的论文中，ClinGen的Variant Curation专家小组概述了他们如何定制指南以解决基因的独特方面，包括听力损失，CDH1(与胃癌和乳腺癌相关)，PAH(与苯丙酮尿症相关)，和PTEN(与肿瘤综合征有关)。临床医生可以使用ClinVar中可用的专家分类基因变体来确定他们在患者中遇到的变异是否会导致疾病。研究人员还可以选择某些基因变异体在他们的实验室进行研究。

“ClinGen和ClinVar是美国国立卫生研究院的不同部分，校外研究界和来自世界各地的临床检测实验室如何共同改进我们共享基因组信息并利用它来改善我们对DNA变异之间关系的理解的很好的例子。序列和疾病，“麻省理工学院麻省理工学院和波士顿麻省总医院临床基因组学家和ClinGen首席研究员Heidi L. Rehm博士说。Rehm博士，Jonathan S. Berg，医学博士，北卡罗来纳大学教堂山分校博士; 休斯顿贝勒医学院医学博士，Sharon Plon博士提供了这些课程的概述，并担任25篇论文特刊的共同编辑。

ClinGen的研究人员还开发了一种评估二级发现的临床可行性的方法，在这种情况下，即使他们不是诊断测试的最初焦点，在一个人身上发现的可能导致疾病的基因组变异。

数据共享

ClinVar数据库汇总了有关基因组变异及其与人类健康的关系的信息，并促进了分享和比较来自不同研究和临床组的基因变异分类的能力。这对ClinGen专家小组的工作至关重要，它允许他们与共享数据的实验室密切合作，以解决基因变异解释的差异，确保为患者提供更准确的结果。

ClinGen的患者登记处GenomeConnect使已接受基因组检测的患者能够将其基因组变异和临床数据贡献给ClinVar。截至2018年4月，来自32个国家的1,601名参与者参加了GenomeConnect。登记处还使患者能够与临床医生，研究人员和其他参与者联系。当执行测试的实验室更新有关其基因变异的信息时，也可以提醒注册表参与者。到目前为止，已经确定了13个更新，并且正在返回给选择接收此信息的参与者。

一种通用语言

为了帮助建立基因组数据库的共同语言以便彼此“交谈”，ClinGen的设计者构建了ClinGen等位基因座，可以对基因变异进行通用鉴定。该登记处是全球基因组学和健康联盟的一部分，该联盟致力于制定标准，以支持负责任的数据共享，以促进基因组学和健康。

“ClinGen和ClinVar研究人员和临床医生不知疲倦地努力策划用于基因组医学和研究的知识，”Erin M. Ramos博士，公共卫生硕士，以及NHGRI的ClinGen项目主任说。“这是一个巨大的挑战，但社区正致力于自动化方法并加快我们的流程。鉴于临床基因组检测正变得越来越普遍，了解哪些基因变异导致疾病是必要的，以提供尽可能最好的护理。”

ClinGen和ClinVar的研究人员将在2018年10月16日至20日的美国人类遗传学会年会上展示他们的工作。

ClinGen主要由NHGRI通过以下三项拨款资助：U41HG006834，U41HG009649和U41HG009650。ClinGen还通过以下三项拨款获得NICHD的内容管理支持：U24HD093483，U24HD093486和U24HD093487。在第一阶段活动期间，NCI通过合同HHSN261200800001E支持ClinGen到2016年。ClinVar得到美国国立卫生研究院内部研究计划，国家医学图书馆的支持。

NHGRI是推进国立卫生研究院基因组学研究的推动力。通过开展和资助世界一流的基因组学研究，培训下一代基因组学专家，以及与不同社区合作，NHGRI加速了改善人类健康的科学和医学突破。

关于Eunice Kennedy Shriver国家儿童健康与人类发展研究所(NICHD)：NICHD负责并支持美国和全世界关于胎儿，婴儿和儿童发育的研究; 孕产妇，儿童和家庭健康; 生殖生物学和人口问题; 和医疗康复。