TCGA研究揭示了前列腺癌基因组多样性的新线索

根据癌症基因组图谱(TCGA)网络的一项研究，前列腺癌的新发现可能使医生能够为患者做出更好的诊断和预后，并为治疗提供新方向。调查人员于2015年11月5日在线发表了对333例前列腺癌肿瘤的深入分析。TCGA由国家人类基因组研究所和国家癌症研究所共同支持和管理，这两个研究所都是美国国立卫生研究院的一部分。

据美国癌症协会称，2015年美国将有超过220,000名男性新诊断为前列腺癌，这使其成为影响男性的第二大常见癌症，也是男性癌症死亡的第二大原因。大多数前列腺癌早期被检测到，但仍然局限于前列腺，位于膀胱下方的核桃大小的腺体。虽然大多数病例仍然是无害的 - 良性 - 几十年来，其他前列腺癌亚型可能具有攻击性，并扩散到身体的其他部位(转移)，使它们极难治疗。目前，医疗服务提供者很难区分哪些癌症将保持无害，哪些癌症会转移。

“直到现在，我们还没有一种可靠的方法来预测原发性前列腺癌通过观察基因组的方式，”纪念斯隆计算生物学项目首席研究员兼主席Chris Sander博士说。 Kettering癌症中心在纽约。“TCGA研究为我们提供了有关肿瘤改变范围的更多信息，可以帮助我们预测疾病的发展。这也将为新临床试验的设计提供信息。”

TCGA研究人员研究了前列腺癌肿瘤的五个方面：

基因突变的数量和种类。

基因融合(当基因相互连接或以其他方式结合时)。

DNA片段的拷贝数(细胞DNA片段拷贝数的异常差异可能导致癌症)。

基因活动，包括何时打开或关闭基因，以及看到多少活动。

DNA甲基化(甲基化学基团被添加到细胞DNA上的许多位置，并像基因的开/关开关一样)。DNA甲基化中的错误可以在错误的时间打开或关闭基因并导致癌症。

研究人员 - 包括共同主要研究人员Nikolaus Schultz，博士，玛丽 - 何塞知识系统负责人和MSKCC分子肿瘤学Henry R. Kravis中心，以及分子肿瘤病理学中心主任Massimo Loda博士波士顿的Dana-Farber / Brigham和女性癌症中心根据这些方面确定了七种癌症或肿瘤亚型。在这7个亚型中，研究人员发现其中4个以基因融合为特征，而其他3个亚型则由SPOP，FOXA1和IDH1基因的突变定义。具有SPOP和FOXA1的亚型突变具有几种基因组特征，表明这些基因的突变导致细胞中的类似破坏导致癌症。

研究人员发现，IDH1基因的突变与白血病和脑癌中的突变相似。这种癌症亚型可以是“篮子”临床试验的候选者，其测试跨癌症类型的类似突变。这种类型的试验的目标是基于突变而不是癌症的解剖位置来个性化患者的治疗。

Sander博士表示，虽然之前的研究已经检查了基因拷贝数或基因突变的数量和种类或前列腺肿瘤中的基因活性水平，但TCGA研究是第一个全面系统地检查多种不同类型数据的研究。规模大。

“我们之前对基因和癌症改变的理解与这些新基因组细节的整合使我们更有信心，这些新的前列腺肿瘤分类将在临床中用于预后和亚型的治疗，”Sander博士说。

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