人类基因组研究所(NHGRI)召集了遗传学家，生物学家，临床医生，生物信息学专家和其他人，为其旗舰基因组测序计划(GSP)的未来提供专家建议。

为期两天的会议题为“ 基因组测序及其后的未来机遇：国家人类基因组研究所的规划研讨会”，是GSP的第三次正式审查，之前的讨论于2005年和2009年进行。上次审议后，增加了新的核心计划，包括努力寻找罕见疾病的原因并将基因组序列信息转移到临床。除了历史悠久的大规模测序和分析中心(LSAC)计划，GSP现在还包括孟德尔基因组学中心计划，临床测序探索研究(CSER)计划和基因组测序信息学工具(GS-IT)。程序。

NHGRI应该继续扮演“基因组学开拓者”的角色，NHGRI主任Eric Green，医学博士，博士说。他说，这意味着支持研究新的DNA测序方法和数据分析技术，并解决基因组测序中的难题。

他说，NHGRI在这一领域的成功将取决于其与其他机构和组织合作的能力。随着基因组学越来越多地进入临床，需要新的战略和伙伴关系来扩大其存在并探索其有用性和成本效益。与会者和发言者在整个研讨会上都回应了这一主​​题。

疾病变种发现

第一天早上的重点是科学的状态。密歇根大学安娜堡分校的Michael Boehnke博士回顾了发现赋予常见疾病风险的变异的现状和机会。他说，未来五年的一个目标应该是促进对人类疾病遗传基础的理解，并利用这些知识改善人类健康。

他说，必须选择投资资源，并指出研究应该涵盖一系列疾病分类。变异发现仅处于起步阶段，需要进行大量研究以确定与疾病相关的变异。

另一个讨论集中在孟德尔疾病，这种疾病很少见，通常是由于单个基因的改变。自两年半前推出以来，孟德尔基因组学中心已经发现了280多种孟德尔疾病的新基因或新的临床特征。三个孟德尔中心分别位于耶鲁大学，华盛顿大学和约翰霍普金斯大学以及贝勒医学院的联合中心。

研究孟德尔基因和变异有助于理解复杂疾病，加拿大蒙特利尔戴维斯医学研究所的医学博士Roderick McInnes说。“识别这些基因可以增强对人类疾病和生物学的理解。因为大多数孟德尔病症极为罕见，仅在少数家庭中发现，孟德尔疾病和病症是个性化医疗的缩影。”

基因组医学

NHGRI支持几种基因组医学计划，以探索将基因组测序信息转移到临床的最佳方法，并了解如何最有效地使用这些信息。理解和解释基因组变异是实施基因组医学的最大挑战之一，田纳西州纳什维尔范德比尔特大学医学博士Dan Roden说。“我们不知道我们发现的许多变种的功能。如果我们弄错了，很多人都有可能获得有关稀有变种的信息而不了解其含义。”

此外，还需要对使用临床基因组测序的结果和成本效益进行更多研究。这项研究应该有助于确定全基因组测序的价值(检查所有基因组，而不仅仅是蛋白质编码区域)，如何识别可行的遗传变异(可能对患者护理有用)以及如何处理偶然发现(无意识的) DNA测序结果可能会增加其他疾病或疾病的风险)。

“如果NHGRI没有采取协调行动，基因组医学的承诺将被推迟，”罗登博士说。“我们需要大量的研究来确定实施的现实.NHGRI需要继续发挥作用。”

在第一天结束时，与会者花了两个小时参加分组会议，讨论从临床基因组测序到比较基因组学的一系列主题。

实施的想法

在研讨会的第二天，演讲者讨论了基于前一晚会议实施思路的方法。

德克萨斯州休斯顿德克萨斯大学健康科学中心的Eric Boerwinkle博士在一次会议上讨论了更好地理解健康和疾病“架构”的必要性。他强调NHGRI需要通过创建大型基因组测序的新工具，变体的大规模功能表征，新的计算模型和非编码变体的研究来支持基础科学家。

随着“临床和个人DNA测序的使用增加，我们所做的基础研究必须首先推动发现。这将改善疾病诊断和转化为治疗，”他说。“与此同时，我们必须开发基础设施，以便临床数据能够推动新发现。”

虽然临床基因组测序的使用正在迅速增加，但绝大多数关于有效性和实施的研究都发生在学术医疗中心。德克萨斯州休斯顿贝勒医学院的医学博士Sharon Plon讨论了在各种医疗环境中进行大规模测序的随机试验的必要性。“研究需要反映全国不同医疗保健和临床环境中的人群，”她说。“NHGRI需要与其他研究机构合作，以选择最佳临床环境，并设计显示使用基因组测序功效的试验。” 她说，它还应该资助研究，以改进将基因组测序用于常规医疗实践的方法，例如决策支持工具。

多次出现的一个问题是市场对推动临床医学中基因组学的使用的影响，以及NHGRI的作用。许多人认为NHGRI应该通过继续投资临床基因组学计划来帮助确定基调。北卡罗来纳大学教堂山分校的James Evans医师表示，NHGRI的临床测序探索研究计划和其他临床基因组学计划“已经表明，在临床中使用基因组学是可能的，甚至可行。这是游戏的早期阶段和结果，需要进行研究以制定标准并找到有效的证据。“

研讨会组织者和GSP项目主管Adam Felsenfeld博士承认NHGRI和基因组学领域面临许多挑战。他说，除了临床基因组学的新机会，特别是在肿瘤学方面，还有许多领域和问题需要解决。他指出需要更多地发现与疾病相关的遗传变异，更好地理解功能基因组学以及基因组如何工作，以及改进的基因组测序和组装方法。他回应了许多研讨会参与者，他们承认需要改进参考基因组。

Felsenfeld博士说，比较基因组学仍然是发现和解释的有力工具，需要得到支持。需要有更好的方法来快速确定研究或临床基因组测序中发现的变体是否对患者护理有用，特别是对于常见疾病。随着NIH支持的计划内外可以获得更多数据，必须使用信息基础设施来广泛获取此类信息。

“这是一个非常激动人心的时刻，部分原因很难，因为有很多机会，”埃文斯博士说。“我们可以进入许多需求和许多吸引人的方向。”