今年5月，“纽约时报”对此进行了暗示，报道了两项新的研究，详细介绍了子宫内膜癌的基因组景观和一种称为急性髓性白血病(AML)的白血病。泰晤士报 - 承认这些研究结果显示子宫内膜癌，卵巢癌和乳腺癌之间存在巨大的相似性 - 这表明这是“最有说服力的证据，即癌症将越来越多地被视为一种主要由其基因指纹定义的疾病，而不仅仅是它所在的器官。起源“。

提到的这两项研究是癌症基因组图谱(TCGA)的一部分，这是一项耗资数百万美元的努力，于2008年开始解决许多类型癌症背后的基因组畸变。TCGA是由国家癌症研究所(NCI)和国家人类基因组研究所(NHGRI)共同支持和管理的合作，这两个研究所都是美国国立卫生研究院(NIH)的两个部分。

由于TCGA研究论文发表在个体癌症 - 胶质母细胞瘤，乳腺癌，卵巢癌和其他癌症 - 并且基因组数据开始积累，研究人员开始注意到癌症的相似性，混乱中的模式。每个“标记纸”都有其惊喜，例如新基因突变和新的癌症亚型。但是，经常和预期的一样，研究人员反复遇到了行为不端的基因和途径的相同字母汤 - TP53，RAS / RTK和HER2，仅举几例 - 主要是破坏对细胞分裂，生长和发育的控制。

正如历史上所做的那样，科学家们现在正在寻找一种新的方法来汇集所有这些信息并查看疾病类型之间的共性，而不是通过器官部位对每个癌症进行孤立。这个主题 - 癌症之间的相似性 - 是一个名为泛癌症倡议的项目的核心。

Pan-Cancer于2012年推出，是TCGA研究的下一个合乎逻辑的步骤。9月，Pan-Cancer项目获得了来自12种癌症类型的5,000多种肿瘤样本的TCGA基因组数据，并在几家期刊的出版物中向全世界宣布。

第一轮泛癌论文包括Nature Genetics的两篇研究论文除其他外，这表明有限数量的基因改变是大多数癌症亚型的原因，并且突变最常发生在基因组的某些区域。在最新的泛癌研究中，研究人员调查了来自21种不同癌症类型的近5,000种肿瘤，揭示了超过30种新的癌症基因。他们的结果 - 在1月5日在线报道的自然 - 表明还有更多的癌症基因尚待鉴定，这意味着需要分析其他肿瘤样本和癌症类型以开发全面的癌症基因目录。这样的目录可能最终有助于塑造个人治疗方法。

虽然TCGA标记论文继续发现更多针对个体癌症的潜在药物靶点，但泛癌报告越来越多地创建了跨越癌症的地形图，生物山脉和山谷，绘制了治疗可能采取的道路。这些地图有可能改变研究人员和临床医生理解和攻击癌症的方式。当研究人员指出有罪的癌症基因，蛋白质和途径时，他们也希望了解他们的行为并学习如何控制癌症过程。他们希望从不同的有利位置发起全球攻击，而不是攻击个别基因或蛋白质目标。

“Pan-Cancer项目首次向我们展示了癌症之间的不同和共同之处，并帮助我们将所有内容都放在一个共同的图片中，”May Goldman Shaw杰出教授Charles Perou博士说。分子肿瘤学，北卡罗来纳大学教堂山分校Lineberger综合癌症中心的遗传学，病理学和实验室医学教授。“这是为未来的研究和治疗策略奠定基础的基本信息。”

例如，他说，科学家和临床医生“暗示基底样亚型乳腺肿瘤，卵巢和肺鳞癌多年来有相似之处，但现在我们可以说基因组变化 - 基因p53的变化，基因拷贝和表达签名的数量 - 在这三个群体中一起被看到并且是独一无二的。“

乳腺癌专家Perou博士说，大多数”明显可药物的目标“是已知的。”现在，我们正处于下一阶段，研究其他更为间接的途径，以及整个染色体区域，而不仅仅是单个基因。泛癌研究正在帮助我们将这些新型目标置于更大的癌症图片中。“

新的治疗方法，临床试验

科学家和临床医生希望泛癌研究最终将有助于为新的治疗方法提供见解，尽管这些方法将是多方面的，而不是一种通用的癌症治疗方法。

“尽管我们看到了许多交叉模式，但如果你看看100名患有相同类型癌症的患者，你会发现许多相似之处和不同之处。癌症的道路很多，”理查德威尔逊博士，导演说。圣路易斯华盛顿大学基因组研究所

肿瘤的基因组分析已经成为常规的肿瘤学实践，特别是在一些较大的中心。患者可以通过一系列已知的突变和改变来描述他们的肿瘤，并且可以排除某些疗法，并且其他人尝试过。

Perou博士说，TCGA泛癌研究和肿瘤的其他基因组分析可能意味着新的分类 - 在某些情况下，癌症诊断和治疗的变化 - 可能意味着多达15%的癌症患者。可以根据这些较新的分类重新制定临床试验。

纽约Memorial Sloan-Kettering癌症中心(MSKCC)的妇科肿瘤学家Douglas Levine医师表示，在某些情况下，临床试验已经开始发生变化。Levine博士帮助领导了针对卵巢癌和子宫内膜癌的TCGA项目。例如，在一些较大的机构中，早期临床试验的入选率较少基于受癌症影响的肾，肺，结肠或其他器官部位，而更多地取决于肿瘤中所见的特定基因组异常。

在MSKCC和其他地方，一种新的方法是“篮子”试验。这些试验不是仅通过原发部位来治疗疾病的亚型，而是测试药物对许多不同癌症中所见的特定分子异常的有效性。在一项试验中，患有不同类型癌症的患者可以分为相似或单独的篮子。

“在一次篮子试验中，我们会描述患者的肿瘤，患者最终会进入HER2，BRAF，EGFR或其他一些突变篮，”Levine博士说。虽然HER2基因扩增 - 意味着HER2基因在细胞中有额外的拷贝- 有助于驱动25%的乳腺癌，HER2突变基因也存在于少数乳腺癌中。然而，在一些膀胱癌，肺癌和胃癌中也发现了相同的改变。

不保证这些相似性会对患者护理产生影响。临床医生和临床研究必须表明，相同的药物或药物混合物对在不同癌症中携带相同关键基因组改变的患者具有相似的影响。例如，对携带BRAF基因突变的黑素瘤有效的药物在具有相同突变的结肠癌中不能很好地起作用。

“Pan-Cancer已经突出了许多癌症常见的途径，并且继续研究将提供一种方法来剖析这些途径并帮助提供线索，为什么一种肿瘤对药物有反应，但其他人没有，”Levine博士说。“为了帮助我们的患者，我们希望了解谁在回应以及为什么。”