改善古生物基因组学

脆弱的DNA分子容易受到损害，并且随着时间的推移会被不相关的DNA污染。DNA序列的标准方法是首先扩增微小的DNA样本。然而，从未经过保存的DNA样品中提取的古老的DNA 1通常难以测序，因为它已经屈服于这些侮辱。

由丹麦哥本哈根大学Ludovic Orlando领导的国际研究团队，包括沙特阿拉伯沙特国王沙特大学的Khaled Al-Rasheid，报道了古老DNA的第一个真正的单分子测序。

真正的单分子测序(tSMS)是一种绕过DNA扩增的最先进技术。它允许对单链DNA进行测序，这使得它比标准方法更快。

奥兰多和他的同事们从永久冻土中保存的马骨中采集了DNA样本超过5万年，并使用tSMS生成了115.9兆碱基。他们在基因组研究中发表了他们的发现。

然后，该团队采用标准测序方法从相同样品中产生76.9兆碱基，并比较两种技术产生的序列。

他们证实标准方法可以从古代DNA中产生可靠的序列，但是用tSMS获得了更高的序列产量，因为这种方法特别适合于对极短片段进行测序。

研究人员对tSMS方案进行了简单的修改，使马DNA的比例增加了三倍，从而污染了DNA。

化石骨的某些部分比其他部分含有更多的DNA，并且在采集了几个不同的样本后，该团队能够识别富含DNA的利基。这可以使未来研究中更容易从化石骨骼中提取更多古老的DNA。

研究人员建议，结合标准和尖端技术，每种技术都针对单个样品的特性进行定制，这将使古代DNA样品的测序具有前所未有的准确性。

“我们可以进一步改善古代DNA的tSMS，”Ludovic说，“通过利用酶处理来获取当前协议遗漏的分子。”

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