医学文献描述了许多医生为患有影响一个器官的病症对患者进行成像研究(X射线，CAT扫描或MRI)的情况，但随后看到另一个器官出现意外异常。是癌症吗?医生应该告诉病人吗?谁应该跟进?未能跟进是否意味着错过了在更早，更可治疗的阶段患上癌症的机会?

或者，这种意外的异常可能是毫无意义的，一些医生称之为偶然瘤(癌症，如癌症，但完全偶然和无害)。在这种情况下，医生可能会徒劳地订购许多昂贵的，可能是侵入性的测试来评估完全良性的幽灵图像。

医生每天都会做出这些艰难的决定。旨在将基因组学从实验室转移到医院和诊所的研究人员和医疗保健专业人员将很快面临类似的挑战，因为他们努力实现基因组医学的潜力。

在最近的年度会议上，美国医学遗传学和基因组学(ACMG)的董事会批准了第一套实践指南，以帮助医生开始在这个新领域进行导航。这些实践指南代表了将基因组信息用于常规医疗护理的重要一步，这是NHGRI 2011年基因组学战略计划中提出的一个关键目标：从基础对到床边制定基因组医学课程PDF文件

问题在于：由于人类基因组测序的成本降至许多其他诊断测试的典型水平，医生将越来越少地对个体遗传条件进行分析(正如他们现在所做的那样)，而是命令完整的基因组序列。但是，就像用于检查偶然识别另一个器官异常的一个器官的X射线一样，对患者基因组序列的检查可能会发现意外的基因组变异，这些变异已知与增加的无关的健康状况风险相关。首先获得基因组序列的原因。

在类似的情况下，医生将这些类型的结果称为偶然发现。一些基因组学家将这些研究结果称为“偶然事件”。医生和患者面临的挑战是确定哪些偶然发现对患者很重要，哪些不重要。

ACMG在制定实施基因组医学实践标准方面迈出了重要的第一步。自2011年11月以来，ACMG董事会任命的一个委员会致力于确定如何最好地处理与患者基因组序列中遇到的偶然发现相关的问题。2013年3月，ACMG根据委员会的工作发布了临床指南 - 这些指导方针为这一新的医学领域奠定了基础，并可能引发进一步激烈的辩论和讨论。

该指南建议医生告诉患者(以及儿童或受损成人患者的家庭)他们的基因组分析是否显示50种左右基因中存在几种类型的基因组变异，这些基因与大约24种疾病密切相关。选择这些基因和疾病的一个关键因素是该疾病是严重的，并且患者和医生可以采取实际的措施来减轻相关风险。如果基因组测序揭示了这些中的任何一种，那么现在的标准护理将是实验室将信息返回给医生，然后医生告诉患者，促使适当的后续护理以保持患者的健康。

新建议中包含的大多数基因组变异是罕见的，导致罕见疾病，如家族性高胆固醇血症(导致早发性心脏病)，视网膜母细胞瘤(一种遗传性眼癌)和马凡综合征(弱化结缔组织，有时导致运动员的主动脉在身体压力下破裂)。由于开发报告变体的初始列表的方式，相对较少的患者将被告知这种偶然的发现。然而，随着正在进行的研究将更多变种与更多疾病联系起来，该清单将不断发展。这套建议包括ACMG董事会定期更新这些指南的建议。

从NHGRI的角度来看，ACMG迈出了重要而勇敢的一步。这些初步建议的制定符合我们研究所使用基因组学改善医疗保健的目标。NHGRI继续投资于技术开发，使基因组测序在成本和准确性方面切实可行，用于临床护理。并且，该研究所最近的一次重组带来了新的基因组医学部门的建立，以集中NHGRI在研究基因组学在医学中的应用的努力。

例如，NHGRI与国家癌症研究所合作，领导一项名为The Cancer Genome Atlas的旗舰研究，其中研究人员使用基因组测序来搜索癌症的基因组根。作为一种基因组疾病，癌症可能是最早由于基因组学而临床护理将发生深刻变化的疾病之一。目前正在进行的另一项相关工作是临床测序探索性研究计划。该计划中的项目吸引了来自各个学科的研究人员 - 从医生到生物信息学家到伦理学家 - 以便专注于将患者的基因组信息返回给医疗保健提供者以及他们的患者的技术，伦理，社会心理和临床意义。

另一项新的NHGRI倡议，称为临床相关变异资源，将开发识别临床上与多种疾病相关的基因组变异的方法。这些努力很可能最终有助于ACMG不断扩大其实践指南所涵盖的基因组变异和疾病列表的努力。

其他几个NHGRI项目还涉及使用基因组测序作为临床研究的一部分，从ClinSeq®到未诊断的疾病计划(很快就是未确诊的疾病网络)，再到基因组医学示范项目，再到电子病历和基因组学(eMERGE)项目。例如，ClinSeq®所做的工作促成了一项支持ACMG倡导的新方法的重要出版物。

在基因组学应用于医疗保健方面，不可避免地会出现挫折和争议。当我们努力将这种新的基因组知识纳入实践时，ACMG指南将挑战一些长期存在的原则。例如，长期以来人们一直认为，个人应该积极选择是否希望了解某些基因组发现。然而，ACMG建议如果患者同意通过描述偶然发现方法的知情同意过程进行基因组测序，那么默认方法是告知他们任何发现的基因组变体在推荐列表中。理由是这些信息具有如此高的医学重要性和实用性，它将返回给患者，就像在X射线上偶然发现一样。在本质上，

ACMG已经为他们的同事和基因组学界做了一项服务，以建立这些实践指南并推进关于临床护理中偶然发现的讨论。这是基因组学的一个激动人心的时刻，但在我们确定如何最好地使基因组学成为医疗保健的标准部分时，仍需要学习和讨论。NHGRI肯定很努力地看到基因组医学成为现实!