研究人员对海洋哺乳动物基因测序进行了研究

由于所谓的非模型生物的基因测序技术的进步，关于海洋哺乳动物物种的进化和生态奥秘的答案可能就在眼前。Kristina Cammen，国家科学基金会生物学博士后研究员和缅因大学即将成为海洋哺乳动物科学的助理教授(2017年5月开始)，领导研究小组在“遗传杂志”上发表了研究结果。审查文件的想法来自两个国际研讨会的讨论，这些研讨会于2013年在新西兰举行的海洋哺乳动物学会两年一次的会议和2015年的旧金山举行。

在过去的十年中，“遗传杂志”的文章指出，技术进步和成本下降已经越来越多地允许进化生物学家和生态学家对海洋哺乳动物使用基因测序技术，这些技术曾经仅用于研究人类和实验室老鼠，即所谓的模式生物。这些技术包括全基因组测序和限制性位点相关DNA或RAD测序。

在这篇文章中，Cammen及其同事研究了自2002年以来几种主要海洋哺乳动物的基因组研究，包括常见的宽吻海豚，虎鲸，南极海豹和北极熊。作者指出，进展从单个基因测序到全基因组测序，并且在基因组规模上，从单个样本测序到测序群体样本。

本文接着提出了关键点，即每种测序技术对生物学家和生态学家都有其独特的益处，致力于了解影响海洋哺乳动物物种的力量。

RAD测序为研究人员提供了针对任何特定物种的数千种遗传标记的新途径。因为这种方法只调查基因组的一部分，所以科学家能够比较和对比来自大量生物的样本。文章指出了一些研究使用这些技术来扩展科学家对影响海豹和海象的遗传模式的理解。Cammen过去曾使用这种技术来探索为什么墨西哥湾的宽吻海豚群体对有毒藻类大量繁殖的敏感性不同。

研究小组表示，全基因组测序的进展使得有可能更深入地了解导致海洋哺乳动物与其陆地亲属分化的进化力量。到目前为止，已有12 种海洋哺乳动物进行了全基因组测序，包括鲸类动物(鲸鱼和海豚)和鳍足类动物(海豹，海狮和海象)的多个代表，以及西印度海牛和北极熊。通过检查这些基因组，科学家们已经能够更多地了解海洋哺乳动物物种如何随时间变化。例如，该论文引用了全基因组测序对长江豚进行的研究表明，在最后一次冰消期中，这种海豚发生了人口破坏。

研究人员还注意到人口基因组重测序可能取得的进展。到目前为止，只有两项将该技术应用于海洋哺乳动物的研究已经发表。一个人检查了来自三个北极熊种群的79个个体的基因组。另一个研究了来自五种进化上不同的虎鲸生态型的48个个体。这些研究揭示了海洋哺乳动物进化史的新见解，包括种群如何分化和选择导致生态位的差异。如果不使用最近开发的基因组测序技术，这些见解以及本文中引用的许多其他见解是不可能的。

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