遗传研究人员对虹鳟鱼的基因组进行序列分析

由法国国家农业研究所的Yann Guiguen博士领导的科学家成功测序了虹鳟鱼Oncorhynchus mykiss的基因组。

虹鳟鱼是一种细长的鱼，两侧从背鳍下面的绿色褪色到黄色和白色，属于鲑科鱼类，也包括鲑鱼，炭火和河鳟。

这条鱼跨越了大自然和养育的世界，在各种温度和水质条件下自然繁荣，同时对驯化做出了很好的反应，以至于人类从太平洋沿岸传播到六大洲的水域中茁壮成长。

在他们的研究中，Guiguen博士及其同事关注的是自1亿年前虹鳟鱼发生罕见的基因组倍增事件以来基因进化的速度。

与涉及突变和有利特征选择的大多数进化过程不同，加倍事件的作用类似于可以编辑和重铸的一段文字的复制草稿，而没有破坏早期版本的风险。

通常情况下，这种倍增事件的后果在科学中失去了，因为它们会被后代的选择性力量驱逐出去。但是，由于1亿年是相对较短的时间，从进化的角度来说，鳟鱼研究人员实际上可以瞥见鱼的进化编辑过程。

“在人类和大多数脊椎动物中，重复事件较老，因此仍然存在较少的重复基因。大多数重复基因丢失或修改得太多，以至于随着时间的推移它们不再被认为是重复的。在鳟鱼和鲑鱼中，我们可以看到这个过程的早期阶段，许多重复的基因仍然存在，“华盛顿州立大学的Gary Thorgaard博士说，该论文的共同作者发表在Nature Communications杂志上。

该小组利用来自虹鳟鱼的基因组序列和基因表达数据显示，自其遗传倍增事件以来，大约一半的蛋白质编码基因已被删除。

它保留了几乎所有microRNA基因，有助于调节基因表达。

科学家们还发现，鱼类保留了原始或接近原始的基因，参与了胚胎发育和神经细胞之间连接的发展。

与这些变化相关的时间表明在诸如此类事件之后的基因进化比先前认为的要慢得多。

“看来，不同情况下的进化速度会有所不同，”Thorgaard博士说。

“有些动物，如肺鱼和腔棘鱼，是'活化石'，已经存在了数亿年而没有太大变化。像北极熊一样的其他人似乎最近也在进化。在鳟鱼基因重复之后，这个过程发生的速度比大多数其他脊椎动物的发生得慢，我们仍然可以看到它继续下去。“

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