疱疹病毒基因研究支持非洲人类迁移理论

在北美，欧洲，非洲和亚洲收集的31种单纯疱疹病毒1型(HSV-1)菌株的基因组序列支持了“非洲外”人类迁徙理论。

“病毒株的排序与人类基因组测序的预测完全一致。我们发现所有的非洲分离株聚集在一起，来自远东，韩国，日本，中国的所有病毒聚集在一起，欧洲和美国的所有病毒，除了一个例外，聚集在一起，“大学的Curtis Brandt教授解释说。威斯康星大学麦迪逊分校是开放获取期刊PLoS ONE上发表的论文的高级作者。

“我们发现的正是人类学家告诉我们的，以及分析人类基因组的分子遗传学家告诉我们的，关于人类起源的地方以及它们如何在地球上传播。”

对人类基因组的研究表明，人类祖先大约在15万至20万年前从非洲出现，然后向东传播到亚洲，向西传播到欧洲。

科学家以前通过观察单个基因或一小群基因来研究HSV-1，但这种方法可能会产生误导。这项新研究使用高容量基因测序和先进的生物信息学来分析来自31个HSV-1基因组的大量数据。

Brandt教授的团队将基因组分成26个部分，为每个部分制作家谱，然后将每个树组合成一个整个基因组的网络树。正是这种分组与现有的人类迁移分析并行。

结果甚至可以发现一些错综复杂的迁移。来自美国的每个HSV-1样品除了与欧洲菌株匹配的样品外，但在德克萨斯州分离的一个菌株看起来是亚洲的。

“我们是如何在德克萨斯州获得与亚洲有关的病毒的?无论是来自远东旅行的人，还是来自美国本土的美国人，他们的祖先大约在15000年前越过白令海峡的陆桥，“主要作者威斯康星大学的Aaron Kolb博士说。 -Madison。

“我们发现了对陆桥假说的支持，因为它与最近的亚洲祖先的分歧日期大约是15000年前。这些日期匹配，所以我们假设这是一种美洲印第安人病毒，“布兰特教授补充道。

HSV-1是该研究的理想病毒，因为它易于收集，通常不致死，并且能够形成终身潜伏感染。由于病毒通过密切接触传播，因此往往会在家庭中传播。此外，HSV-1比人类基因组简单得多，这降低了测序成本，但其基因组比同样用于此类研究的另一种病毒大得多。遗传学通常归结为数字游戏;较大的数字产生更强的证据，因此更大的基因组产生更多的细节。

“但真正跳出研究的是明确支持非洲外的假设。我们的结果显然支持人类学数据和其他遗传数据，这些数据解释了人类如何从非洲进入中东并开始从那里传播，“勃兰特教授总结道。

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