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研究人员对70万岁马的基因组进行序列分析

遗传科学家对加拿大育空地区Thistle Creek的永久冻土中保存最近70万年的中更新世早期马的骨骼中保存的短片DNA进行了测序和分析。

中国现代马(Joy Boffin / CC BY 2.0)

与可追溯到过去10万年的育空,阿拉斯加和西伯利亚未被冰雪覆盖的地区常见的小冰河时期的马化石不同,阿尔伯塔大学的Duane Froese博士发现的Thistle Creek马化石的大小至少相当于一匹现代马。

科学家们已经从沉积物中的火山灰中找到了永久冻土层的年代,并知道它大约有70万年的历史 - 代表了北半球已知最古老的冰。他们也知道化石同样古老。

他们从化石中提取胶原蛋白,发现它保存了血液蛋白质,并且骨骼中存在古老DNA的短片段。

DNA显示,马落在所有现代和古代马DNA的多样性之外,其序列与其地质年龄一致。经过几年的努力,马的基因组草图被组装起来,为马的进化提供了新的见解。

这项研究在“自然”杂志上发表,该研究显示,这匹马属于一条线,包括所有现代马匹和最后剩下的真正的野马,来自蒙古大草原的普氏原羚马。

这个拥有70万年历史的马基因组 - 以及43,000年前的马马Equ基因组,6只现代马和一头驴的基因组- 使得该团队能够估计突变在一段时间内的累积速度。此外,新的基因组揭示了与主要气候变化同步的马群中严重的人口波动事件。

“对中更新世的第一个基因组进行测序绝不是直截了当的,”研究的主要作者,哥本哈根大学的Ludovic Orlando博士说。

“这在方法上具有挑战性,但显然有些参数比其他参数效果更好,”共同作者,哥本哈根大学的Eske Willerslev教授说。

“因为70万年的进化和损害,如果没有对DNA序列本身进行任何修改,它就不会发生。我们必须通过将它们与当今马的基因组对齐来提高我们识别修改和发散的古代马序列的能力。“

科学家们还解开了关于普氏原羚马的进化起源的长期谜团。他们透露,普氏原羚的马种群是从大约5万年前导致现今驯养马的血统中分离出来的。他们还表明纯正的普氏原羚马谱系今天仍然存在。这表明Przewalski的马可能具有遗传可行性,因此值得保护。

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