噬菌体塑造微生物组和代谢组

肠道微生物组是一个复杂的，相互关联的物种生态系统。而且，像任何生态系统一样，有些生物是捕食者，有些是猎物。本周发表在Cell Host&Microbe上的一项新研究调查了噬菌体 - 感染和杀死细菌的病毒对微生物组的影响。

“我实验室的主要兴趣之一是了解肠道微生物组动态的变化。噬菌体是微生物组的一个重要组成部分，但尚未进行过多次研究，“哈佛医学院的共同对应资深作者Georg Gerber说。“有些人正在探索噬菌体治疗，使用噬菌体杀死微生物，但噬菌体也在肠道中自然发现，与生态系统的其他部分共存。我们想知道他们在那里做了什么。“

为了解决这个问题，研究小组用一组确定的人类细菌物种定植了老鼠的肠道，然后添加了噬菌体，追踪每种微生物的生长。利用高通量测序和计算分析，该团队发现噬菌体引起了他们预期捕获的物种的消耗，但对生态系统的其他部分产生了波动效应 - 包括非目标物种的大量繁殖。

除了研究对微生物的影响外，该团队还研究了可能来自宿主和细菌的代谢组 - 化学物质的影响。他们发现，当他们用噬菌体调节微生物组时，他们可以看到代谢组的靶向变化，包括神经递质水平和胆汁酸的变化。

“我们可以用噬菌体来调节这些活动吗?这可能是一种干预条件，例如抑郁症，你想要改变神经递质水平吗?“格柏问道。“即使它们不被用作直接治疗药物，我们的研究表明噬菌体可能是了解改变微生物组的其他疗法的潜在影响的良好工具。”

考虑到营养不良可能对代谢组和微生物组产生的深远影响，格柏及其同事对研究发展中国家噬菌体和营养不良的交叉点特别感兴趣。

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