新测试可以诊断来自热带地区的416种病毒

巴西圣保罗大学(USP)的研究人员开发了一个平台，该平台可以分析患者的临床样本，以诊断出世界热带地区发现的416种病毒的感染情况。

根据其创建者的说法，该工具可以由Adolfo Lutz研究所，Oswaldo Cruz基金会(Fiocruz)和巴西Evandro Chagas研究所等参考实验室使用，通过检测可能导致人类流行的病原体来协助流行病学监测。

由圣保罗大学里贝朗·普雷图药学院(FCFRP-USP)教授Victor Hugo Aquino协调并由FAPESP支持的该研究项目的结果已发表在《公共科学图书馆·被忽视的热带病》上。

文章的主要作者阿基诺说：“夏天到来时，怀疑有登革热，寨卡病毒或基孔肯雅热感染的患者人数将会增加。” “传统方法经常无法确认对这些疾病的诊断，因此我们不知道正在传播哪些病毒。”

在他看来，如果Zika开始在巴西流行时就可以使用这种工具，则有可能将其传播范围限制在最初的暴发地点。他说：“我们花了很长时间才意识到流行病正在发生，因为当时没有人想到寨卡。”

除了病原体外，该平台还可以检测其他零星的病原体，但可能会成为流行病。

例子包括Mayaro(一种与基孔肯雅病毒有关的甲型病毒)，它是通过野生蚊子(如Haemagogus janthinomys)传播的，而Oropouche迄今已将流行病限制在亚马逊地区的河沿社区，并且主要通过Culicoides paraensis物种的mid虫传播。

阿基诺说：“还有其他几种病毒尚未引起人类问题，但有一天可能会引起人类问题。” “它们一直在发展，随着自然环境的恶化，曾经局限于自然环境的传染病会传播到更远的地方。”

尽管该平台最主要的目的是检测由节肢动物传播的病原体，例如蚊子和壁虱，但它也可以诊断由小型哺乳动物传播的传染原，例如汉坦病毒。

阿基诺解释说，该选择涵盖了所有热带地区存在的病毒，这些病毒的DNA序列保存在GenBank中，GenBank是由国家生物技术信息中心(NCBI)维护的公共数据库，该中心是美国国家医学图书馆(NLM)的一部分。

这个怎么运作

该平台由一个DNA微阵列载玻片和八个相同的子阵列组成，其中包含至少重复复制三次的病毒探针，以完成包含15,000个探针的阵列。每个探针包含与待检测病毒基因组互补的60个核苷酸的序列。

根据阿基诺的说法，这些序列是根据GenBank利用生物信息学提供的信息安装的。

阿基诺说：“如果血液样本中包含微芯片中包含的416种病毒中的一种，病原体的基因组将与其中一种探针结合，产生可以被扫描仪检测到的标记。”

读取结果的设备与微阵列分析中用于基因表达分析的设备相同。

阿基诺说：“起初，由于成本高昂，测试不会针对整个人群。” “它将用于疑似登革热，寨卡病毒或其他发热性疾病的患者，这些患者无法通过常规方法进行诊断。”

该方法已使用FCFRP-USP病毒学实验室提供的20种病毒进行了验证。验证测试并未指出交叉杂交，交叉杂交会为一种以上的传染原产生积极的结果，并妨碍正确鉴定单个病毒。

然而，该方法被证明可有效诊断合并感染病例，例如同一名患者同时被寨卡病毒和登革热感染。

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