研究人员对莫哈韦沙漠乌龟的序列基因组

亚利桑那州立大学领导的一组科学家对莫哈韦沙漠乌龟(Gopherus agassizii)的基因组进行了测序，该物种是莫哈韦沙漠的一种长寿物种。结果可以帮助动物生存越来越多的威胁。

莫哈韦沙漠乌龟是大约三千五百万年前在北美出现的六种沙漠乌龟之一，可以在加利福尼亚，内华达州，犹他州和亚利桑那州找到。

也被称为阿加西(Agassiz)的沙漠龟，该物种已受到栖息地丧失，呼吸道疾病和其他人为因素的严重影响。例如，在该物种的一个区域中，密度范围从1979年的225个人/ km 2下降到1992年的约75个人/ km 2。

莫哈韦沙漠乌龟在美国《濒危物种法》中被列为“受威胁”，并被国际自然保护联盟(IUCN)视为“易受伤害”。

为了帮助保护该物种遗传多样性的保护工作，亚利桑那州立大学教授Kenro Kusumi和他的合著者生成了一个全基因组参考序列，并带有基于成人骨骼肌，肺，脑和血液的深转录组序列的注释。

亚利桑那州立大学的合著者马克·托利斯博士说：“莫哈韦沙漠乌龟基因组是保护该物种的重要资源，特别是因为该种群正遭受严重疾病的困扰。”

“研究人员尚未完全了解其原因或使乌龟易感的原因。”

“对该基因组进行解码将有助于我们对哪些乌龟基因进行足够迅速的进化以帮助它们克服这一威胁进行分类。”

研究人员获得了特定乌龟标本的遗传数据，组装并注释了基因组，并了解了乌龟的进化史。

Kusumi教授说：“从技术上来说，对基因组进行解码变得容易得多。”

“目前的挑战是对乌龟基因组中的信息进行解码。我们可以利用与小鼠和人类基因组相似性的线索。”

“找到广为人知的'大海捞针'将是确定指导针对传染病的免疫反应的基因，以及在莫哈韦沙漠恶劣条件下生存的能力。”

他补充说：“对我们来说，了解乌龟多样性在其地理范围内的位置非常重要。”

“确定遗传多样性的热点有助于从保护的角度管理物种，并保护乌龟种群，以便在未来几年更好地应对未知的挑战。”

研究小组还分析了莫哈韦沙漠乌龟与其姐妹物种索诺兰沙漠乌龟(Gopherus morafkai)的遗传差异。

“我希望这项研究将使其他机构能够提出新的问题，如果没有这项研究他们将无法提出这些问题，”合著者，亚利桑那州立大学的Greer Dolby博士说。

“例如，'乌龟必须与哪些免疫基因对抗病原体?他们的免疫系统如何在面临许多威胁的环境中发挥作用?而且，不断变化的环境将如何影响这一点?” 这些是管理物种时要回答的重要问题。现在，我们可以开始调查了。”

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