科学家开发了一种新方法来了解DROSHA蛋白切割的位置和位置

我们身体的每个细胞都是一个复杂机制的管弦乐队的结果，这些机制可以控制哪些基因在任何特定时间都被表达。部分地，这可能归功于几种类型的RNA分子的协调，例如microRNA(miRNA)。基础科学研究所(IBS)内的RNA研究中心的研究人员开发了一种名为fCLIP-seq的新技术，该技术可分析由RNA切割蛋白DROSHA产生的miRNA片段。DROSHA调节了几个过程，例如神经元发育，骨髓形成和RNA病毒的抑制。因此，预计本研究将开辟新途径，以了解DROSHA在这些重要生物现象中的作用。Molecular Cell提供了对这些发现的完整描述。

miRNA是基因调控的一个重要和古老的组成部分，它调节多达30-60%的哺乳动物蛋白编码基因的表达，通常使它们沉默。超过2,000种miRNA存在于人体细胞中，在发育，细胞分化，细胞分裂，细胞死亡和癌症发展中发挥着各种关键作用。成熟的miRNA是短RNA分子，长约22个核苷酸，源自多步骤过程，其开始于称为初级miRNA(pri-miRNA)的较长RNA片段。DROSHA功能是将这些pri-miRNA切割成较短的片段。

该研究是pri-miRNA上DROSHA切割位点的第一次基因组规模分析。“fCLIP-seq代表甲醛交联，免疫沉淀和测序。通过用甲醛处理细胞，我们设法保持DROSHA与其RNA结合物之间的结合，这样我们就可以研究DROSHA与其结合的位置和切割位置， “该研究的第一作者KIM Baekgyu解释说。“这一结果不仅可以作为miRNA研究的良好数据库，而且可以加深我们对miRNA生成的理解。”

该研究小组在pri-miRNA上发现了数百个DROSHA切割位点，包括即使在世界上最大的miRNA数据库miRBase中也未发现的新信息。

有趣的是，IBS生物学家在DROSHA处理后发现了额外的miRNA末端修饰，预计这对miRNA生物发生的调节很重要，miRNA生物发生的失调通常与疾病有关，特别是与癌症有关。

此外，他们发现多种替代DROSHA切割模式，从相同的pri-miRNA前体开始产生不同的miRNA产物。仅在极少数miRNA中报告，IBS科学家发现这实际上发生在几种情况下。

该研究小组还发现，DROSHA可以切割数十种非pri-miRNA靶点，这表明DROSHA具有新的可能功能，可以进一步探索。

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