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新的生物信息学工具识别和分类CRISPR-Cas系统

2018-12-06 18:19:33 • 来源：

旨在提高实用性和可用性日益多样化的CRISPR-Cas基因组编辑系统,新的CRISPRdisco自动管道可以帮助研究人员识别CRISPR重复和中科院基因在基因组装配。免费软件提供标准化、高通量分析方法,检测CRISPR重复和准确地分配类,类型和子类型,CRISPR日报》发表的一篇文章中所描述的。

新的生物信息学工具识别和分类CRISPR-Cas系统

CRISPR发现(CRISPRdisco)起源于Rodolphe Barrangou的北卡州立大学的实验室,博士CRISPR杂志的主编。Barrangou博士和他的同事亚历山德拉。克劳利NC州立大学罗利和詹姆斯•亨利,AgBiome,达勒姆,数控,合著文章题为“CRISPRdisco:一个自动化管道CRISPR-Cas发现和分析的系统。”

在这项研究中,研究人员使用CRISPRdisco识别和分类可能从NCBI RefSeq CRISPR-Cas系统2777年完整的基因组数据库。他们强调的重要性,能够区分完整和不完整的CRISPR系统和确定潜在的完整和功能之间的联系CRISPR-Cas系统体内和CRISPR-Cas多样性硅片。重要的是,这个平台通过GitHub是现成的,我可以让新手和描述CRISPR-Cas系统各种基因组数据集。

“新生物信息学工具、程序和数据库是有助于推动CRISPR革命,我们很乐意提供一个论坛来验证这些重要的平台,”凯文·戴维斯说,博士CRISPR杂志的执行编辑。

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