猴子和病毒一起有一百万年

包括MIPT基因组工程实验室生物信息学家Vasily Ramensky在内的国际研究团队根据其基因组对6种非洲绿猴进行了分类，研究了它们对猿猴免疫缺陷病毒(SIV)的遗传适应性，并制作了基因表达图谱其中一个物种。该研究的结果发表在Nature Genetics的两篇文章中。

测序和基因组比较工具的引入标志着动物系统学新时代的开始，使研究人员能够在建立遗传相关性方面获得更高的准确性，而这种相关性并不总是反映在形态学上。通过比较遗传信息，我们现在可以确定遗传多样性最低的物种边界。在这项研究中，研究人员阐明了非洲绿猴(也称为黑长尾猴)的种类之间的遗传关系。他们确定了来自非洲各地的六种物种，一种来自巴巴多斯，另一种来自加勒比岛屿圣基茨和尼维斯。但是，基因组分析不仅仅是一种改进分类法的方法：它可以提供对物种的进化和地理分布以及物种特异性遗传疾病的见解，

黑长尾猴是与人类关系最密切的非人类灵长类动物。它们长期以来一直是重要的生物医学模型，广泛用于行为研究，抗病毒感染研究和疫苗开发。众所周知，Vervet是SIV的天然宿主，SIV是HIV的近亲。尽管它们经常被病毒感染，但SIV对它们没有任何伤害：它们已经进化出了与病毒共存并避免免疫系统退化的能力。在这里报道的两篇论文之一中，研究人员分析了一组与SIV相互作用的黑长尾猴基因。

遗传分析表明，第一次与SIV相遇的情况发生在大约一百万年前。随着时间的推移，一个原始宿主物种分化成许多，每个物种都获得了自己对SIV的遗传适应。研究与黑长尾猴中宿主 - 病原体相互作用有关的生物学机制提供了关于与免疫缺陷病毒一起生活的数百万年的数据。

一个生物体中的所有细胞携带相同的基因组。但是，取决于组织和生物体的年龄，细胞可以具有不同组的活性或表达的基因，其负责蛋白质合成。在MIPT的基因组工程实验室工作的Vasily Ramensky与他的外国同事合作，在各种组织中创建了一个公开的基因表达图谱- 包括四个大脑区域 - 来自Vervet Research的60只不同年龄的黑长尾猴(Chlorocebus aethiops sabaeus)殖民地。与人类受试者研究相比，涉及非人类灵长类动物的研究提供更可靠和可重复的数据有以下几个原因：生活条件，饮食和其他环境因素是统一和可控的。另外，组织制备快速且标准化。最后，遗传多样性较低，因为生活在圈养殖民地的所有动物都来自一个小的共同祖先种群。“由于全基因组测序，我们积累了大量关于人类和许多密切相关物种的遗传物质的数据，”拥有物理和数学博士学位并专攻分子生物学的拉曼斯基说。“然而，我们对基因所起的作用仍然知之甚少。我们创建的图谱提供了七个组织的基因表达数据和七个发育阶段的基因表达数据。对于统计遗传学家来说，它将作为理解基因作用的工具。在动物的生命中。“

动物发育过程中每个阶段的多组织基因表达数据将有助于确定基因功能并了解与该生物体相关的功能和发育模式。例如，研究人员已经表明，在两个大脑区域(即Brodmann区域45和尾状核)中，vervets的年龄与负责发育和变化的基因的表达之间存在直接关联。这些基因的表达与年龄相关的疾病有关。

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