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研究人员改进了使用环境DNA鉴定水生物种的方法

确定哪些鱼生活在各种水体中对于研究这些种群的科学家来说是一项艰巨的任务。例如,识别入侵或濒危物种通常依赖于捕获它们的能力。现在,根据发表在“ 生态学与进化方法”中的一项新研究,研究人员通过使用这些生物留下的生物材料(称为环境DNA(eDNA))改进了他们追踪物种的方法,eDNA的痕迹携带与直接DNA样品相同的重要信息,例如血液或组织样品。想想法医科学家所做的工作,他们可以识别一缕头发中的个体。

研究人员改进了使用环境DNA鉴定水生物种的方法

到目前为止,研究人员认为生物体在水环境中脱落的DNA显着降解,质量较差,因此很难将这些碎片与特定物种相匹配。

事实证明,鱼类流入水中的细胞保护了紧密盘绕的DNA。“我们成功地检测并处理了长而完整的DNA片段,”基因组学和生物信息学核心设施主任,生物科学系和诺瑞大学环境变化倡议副教授Michael E. Pfrender说。圣母院。“这完全改变了我们只能使用高度降解的eDNA的短片段的普遍看法。现在,我们可以开始使用从这些长链DNA中提取的信息来开发更准确的物种鉴定并检测物种内的遗传变异。”

研究人员从区域湖泊,池塘和溪流中采集水样,并使用聚合酶链反应(PCR)技术从这些环境中发现的eDNA扩增或复制整个线粒体基因组。

通过这种改进的方法,科学家可以更详细地了解各种水生栖息地的生物多样性。“正在不断努力填充数据库,如国家生物技术信息中心(NCBI)Genbank,”Pfrender说。“我们没有对我们想监测的所有生物多样性进行遗传签名。这些数据库对于帮助我们识别生活在这些社区内的各种物种至关重要。”

研究中使用的方法不仅更准确,而且在寻找和管理入侵物种方面更有效。

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