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推动DNA测序的界限

2019-01-02 11:32:31 • 来源：

在新墨西哥大学(UNM)创建的一家开发技术的年轻公司正致力于破坏DNA测序领域。Armonica Technologies，LLC正在开发一种DNA测序平台，可在几分钟内对完整的人类基因组进行测序。该公司的目标是使该技术成为精确医学研究应用的DNA测序的黄金标准。Armonica选择了STC.UNM的专利和正在申请专利的技术组合。该技术被称为“光学纳米孔测序”，并使用纳米通道通过纳米孔传递单个DNA分子。纳米孔是非常小的孔，内径为1纳米(十亿分之一米)。纳米孔足以减慢DNA易位，使用光学技术产生大规模平行的单碱基分辨率。

推动DNA测序的界限

以下是纳米孔测序的工作原理：当纳米孔浸入导电流体时，可以施加电压以产生电流。电流对纳米孔的大小和形状敏感，因此如果DNA链穿过纳米孔或在纳米孔附近，则电流量发生变化。当DNA分子通过纳米孔时电流的变化代表DNA序列的读数。

“快速增长的DNA测序市场存在未满足的需求，”Armonica总裁兼首席执行官Scott Goldman表示。“今天的标准基因组测序方法需要大量的文库制备，并产生与重新组装数据集相关的大量计算和生物信息学问题.Armonica将通过引入不需要文库制备的测序仪器来解决这些问题，并将产生高达50,000碱基的读数结合100万的平行性。这种方法将净化500亿个碱基 - 足以在几分钟内对整个人类基因组进行测序。“

创新的纳米孔技术由杰出教授Steve Brueck，研究助理教授Yuliya Kuznetsova和UNM高科技材料中心(CHTM)的博士后研究员Alexander Neumann和UNM化学与化学生物学系的Jeremy Edwards教授合作开发。 Redondo Optics首席执行官Edgar Mendoza。

“Nanopore测序分析长DNA链，长读取可以更准确地鉴定基因组变异，”Brueck说。“因此，这种方法可以实现更彻底，更快速，更准确的基因组分析，使研究人员能够大大提高新发现的能力。纳米孔测序的挑战之一是提高分辨率，使其能够检测单个核苷酸(碱基)。“

“我们相信我们的纳米通道技术会破坏这个行业，因为它可以产生非常长的读数以获得更高的精度，使用光学技术实现非常高的并行性，以及更高的吞吐率以获得更高的处理速度。对于研究人员来说，它将是一种经济实惠的工具，”STC首席执行官丽莎说。 Kuuttila。“这项技术组合代表了基因组测序技术的飞跃，这对DNA测序行业来说是一个巨大的好处，正在经历爆炸式增长。该公司的研究和开发目前正在UNM的CHTM进行，该研究中心在全球享有盛誉。发明具有破坏性的纳米级技术并提供出色的科学专业知识和技术支持。我们对该技术的潜力感到非常兴奋，并相信公司的愿景。“

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