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改进的基因表达图谱显示许多人长的非编码RNA实际上可能是功能性的

2019-01-03 09:47:50 • 来源：

虽然曾经有人认为基因调控生物功能几乎完全是通过转录成编码RNA然后翻译成蛋白质，但现在已知图像更加复杂。事实上，研究基因与疾病之间关系的研究表明，大多数疾病变异是在蛋白质编码基因之外发现的。

改进的基因表达图谱显示许多人长的非编码RNA实际上可能是功能性的

RIKEN领导的FANTOM联盟在十多年前开创了非编码RNA的发现，首次揭示了哺乳动物基因组转录环境的复杂性。FANTOM联盟继续处于非编码RNA起源和功能研究的前沿。在他们的最新作品中，发表于“ 自然”该团队已经生成了一个全面的人类长链非编码RNA图谱，其基因模型得到了显着改善，使他们能够更好地评估这些RNA的多样性和功能性。今天绘制RNA转录图谱的大多数尝试依赖于测序技术，这些技术并不总是准确地鉴定RNA转录物的起点或5'末端。为了克服这一局限，该团队使用了一种名为基因表达分析(CAGE)的技术，该技术是在RIKEN开发的，用于构建具有精确5'末端的人类长非编码RNA图谱，精确定位基因组中的位置。他们的转录被启动了

该图谱包含27,919个长非编码RNA，首次总结了它们在主要人类细胞类型和组织中的表达模式。通过将该图谱与基因组和遗传数据相交，他们的结果表明这些RNA中的19,175个可能是功能性的，暗示可能存在与人类中大约20,000个蛋白质编码基因一样多或甚至更多功能的非编码RNA。基因组。

“科学界对于从我们的基因组产生的数千个长非编码RNA是否具有功能性或仅仅是嘈杂的转录机制的副产品存在争议。” 西澳大利亚大学Harry Perkins医学研究所的Alistair Forrest教授和RIKEN生命科学技术中心(CLST)的高级访问科学家，该论文的相应作者之一，“通过整合改进的基因模型根据基因表达，进化保守和遗传研究的数据，我们发现有令人信服的证据表明这些长的非编码RNA中的大多数似乎具有功能性，其中近2,000种我们揭示了它们可能参与疾病和其他遗传特征。“

“有趣的是，”该论文的第一作者CLST的Chung-Chau Hon说，“大多数长的非编码RNA似乎是由增强子元件产生的。它加深了我们对长非编码RNA的大部分异质起源的理解。 “。

根据CLST的Piero Carninci的说法，“改进的基因模型和来自该地图集的人类长非编码RNA的广泛功能提示可以作为Rosetta Stone，让我们通过实验研究它们的功能相关性，作为我们正在进行的工作的一部分。即将出版的FANTOM联盟。我们预计这些结果可能会进一步推动我们对基因组非编码部分功能的理解。“

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