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NIST专利用于验证小鼠细胞系的DNA方法

2019-01-03 10:31:23 • 来源：

“一个错误的身份”可能会推动最新的间谍电影或犯罪小说的情节，但这只是遗传学家，肿瘤学家，药物制造商和其他从事小鼠细胞系工作的人的故事，这是最常用的实验室模型之一遗传研究系统。由于实验室技术差和人为错误而被污染或错误识别的细胞系导致研究不准确，出版物被收回并浪费资源。事实上，许多科学基金组织，如美国国立卫生研究院，现在要求科学家在授予研究资助之前验证其细胞系的特性和质量。

NIST专利用于验证小鼠细胞系的DNA方法

为了应对这一挑战，美国国家标准与技术研究院(NIST)正在与合作伙伴合作设计工具，建立数据集，并进一步开发和标准化NIST的系统，以验证小鼠细胞系。这项努力的最初里程碑之一是最近授予的美国专利(第9,556,482号)，该专利使用NIST鉴定的短串联重复序列(STR)标记 - 在基因之间发现的DNA的微小重复片段 - 用于小鼠细胞系。该方法可用于验证细胞系是否来自特定小鼠，法医专家可以使用DNA证据确认人的身份。一旦即将完成STR标记的实验室间测试，这将成为世界上第一个验证小鼠细胞系认证的方法。

新的NIST认证方法使用非编码的STR标记(即，不像基因那样提供蛋白质生产的指令)具有特定核苷酸碱基序列的DNA片段 - DNA的四个关键组分称为腺嘌呤，胞嘧啶，鸟嘌呤和胸腺嘧啶。每个STR被认为是遗传匹配的单独标记，因为它重复的次数对于物种内的个体是独特的。例如，细胞系可以具有一个STR序列 - 例如GATA - 重复五次，另一个 - 例如GTAT六次，三次七次等等。如果另一个细胞系具有相同数量的相同STR序列的高百分比，则认为它们可能共享共同的祖先。

几十年来，人们已经记录了错误鉴定的人类细胞系及其引起的破坏。例如，两个受污染的细胞系负责在20世纪50年代末到60年代中期之间使大约7亿美元的研究和大约7,000种出版物无效。国际细胞系认证委员会是一个监测和提高认证问题意识的志愿者小组，目前在其数据库中列出了近500种错误鉴定的人类细胞系。幸运的是，现在有标准和公共数据库可供实验室用于确认其人类细胞系的特性。

相比之下，NIST微生物学家Jamie Almeida表示，小鼠细胞系中的错误识别程度尚不清楚，目前还没有对其进行鉴定的指导原则。

“这就是为什么NIST一直致力于STR标记的独特，易于解释和能够区分不同的小鼠细胞系，”Almeida说。“此外，我们与生物材料管理和标准的全球领导者ATCC [以前的美国典型培养物保藏馆]合作，进一步开发用于认证的STR技术并建立鼠标细胞系认证联盟。该联盟由已同意与NIST和ATCC合作，使用NIST识别的STR标记测试和验证专利认证方法的组织。“

该联盟还将创建一个共识标准，以统一如何跨实验室进行身份验证，并建立一个公共数据库，定义哪些STR配置文件识别哪些小鼠细胞系。

“将来，我们希望将NIST鉴定的小鼠STR标记物和鉴定方法纳入市售的检测试剂盒中，”Almeida说。“拟议的试剂盒结合共识标准和细胞系数据库，将为全世界的研究人员提供确保其小鼠细胞系特性所需的工具。”

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