研究人员开发技术允许他们绘制重要的调控DNA区域

很长一段时间被认为是“垃圾DNA”，我们现在知道基因之间的区域也能发挥重要作用。这些DNA区域的突变会严重损害人类的发育，并可能在以后的生活中导致严重的疾病。然而，到目前为止，很难找到调节DNA区域。慕尼黑工业大学计算生物学教授Julien Gagneur教授和哥廷根生物物理化学马克斯普朗克研究所(MPI)Patrick Cramer教授现已开发出一种寻找调节DNA区域的方法。活跃和控制基因。

该基因在我们的DNA中包含详细的蛋白质组装说明，“工人”实施和控制我们细胞中的几乎所有过程。为了确保每种蛋白质在正确的时间在我们身体的正确位置完成其任务，必须严格控制相应基因的活性。该功能由基因之间的调节DNA区域接管，其充当复杂的控制机制。“监管DNA区域对于人类发育，组织保存和免疫反应至关重要，”生物物理化学MPI分子生物学系主任Patrick Cramer教授解释说。“此外，它们在各种疾病中发挥着重要作用。例如，

当调节DNA区域活跃时，它们首先被复制到RNA中。“由此产生的RNA分子对我们的研究人员来说有一个很大的劣势：细胞迅速降解它们，因此直到现在才很难找到它们，”最近从路德维希 - 马克西米利安大学基因中心搬迁的Julien Gagneur教授说。到慕尼黑工业大学。“但正是这些短寿命的RNA分子通常作为重要的分子开关，专门激活我们身体某个部位所需的基因。如果没有这些分子开关，我们的基因将不起作用。”

短寿命分子开关的锚

Cramer团队的成员BjörnSchwalb和Margaux Michel以及Gagneur集团的科学家Benedikt Zacher现在已经成功开发出一种高灵敏度的方法来捕获和识别甚至非常短暂的RNA分子 - 所以称为TT-Seq(瞬时转录组测序)方法。结果发表于6月3日着名科学期刊“ 科学 ”杂志的最新一期。为了捕获RNA分子，三位初级研究人员使用了一个技巧：他们为细胞提供了一种分子作为锚的作用，持续了几分钟。随后细胞将锚结合到它们在实验过程中制备的每个RNA中。在锚的帮助下，科学家最终能够将短寿命的RNA分子从细胞中捕获并检查它们。

“我们用TT-Seq方法捕获的RNA分子提供了在特定时间内在细胞中活跃的所有DNA区域的快照 - 基因以及迄今为止很难找到的基因之间的调控区域，”克莱默解释道。“通过TT-Seq，我们现在有了一个合适的工具，可以更多地了解基因在不同细胞类型中的控制方式以及基因调控计划的工作原理，”Gagneur补充道。

在许多情况下，研究人员非常清楚哪些基因在某种疾病中起作用，但不知道涉及哪些分子开关。Cramer和Gagneur周围的科学家希望能够利用这种新方法揭示在疾病出现或病程中发挥作用的关键机制。在下一步中，他们希望将他们的技术应用于血细胞，以更好地了解患有艾滋病的患者中HIV感染的进展。

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