大部分微生物组研究的重点是生活在肠道系统中的细菌群落的平衡，以及它们对健康和疾病的影响。然而，胃肠道微生物组不仅包含细菌，它还是单细胞真核生物和病毒的家园。新加坡国立大学(新加坡国立大学)Yong Loo Lin医学院的一组科学家进行的实验室和体内研究现已证明了常见肠道真核生物囊胚杆菌的一种亚型如何直接杀死良好的肠道细菌双歧杆菌，并且减少了另一种良好的微生物菌细菌Lactobacillus的数量。

“这是第一项详细的研究，显示了人类肠道常见的单细胞真核生物囊孢杆菌与宿主微生物群之间的因果关系 ，”新加坡国立大学医学院微生物学和免疫学系的研究负责人Kevin Tan博士评论道。 。“我们揭示了它如何减少有益细菌的数量，这反过来又可能导致肠道微生物群不平衡和肠道健康状况恶化。”

新加坡国立大学的研究小组在一篇题为“ 病原性囊胚菌 亚型与肠道微生物群之间的相互作用：体外和体内研究 ” 的论文中描述了其在微生物组中的研究和发现。

囊胚是人类和其他动物宿主中常见的肠道真核生物。虽然许多研究表明单细胞生物是良性的人类肠道共生，但其他研究表明，囊胚与胃肠疾病，肠易激综合征，炎症性肠病和肠道微生物群的破坏有关。

国大作者评论说，这种研究结果的差异可能是因为囊胚菌有不同的亚型，这可能对肠道微生物群产生不同的影响。“事实上，有人认为，与囊胚相关的微生物群组成可能依赖于生物体的亚型同一性......这些先前研究中的一些重要限制因素是囊胚菌的亚型，其在致病潜力方面存在差异，不受控制或确定。“

考虑到这一点，研究小组研究了囊胚菌ST7 的特定亚型(ST)与肠道微生物组中发现的不同类型细菌之间的相互作用。已知ST7 囊胚虫具有在其他亚型中未见的致病性质，并且对甲硝唑具有抗性，甲硝唑是治疗真核单细胞病原体的首选药物。研究还表明，ST7可以破坏肠道衬里。虽然已经在新加坡报道了囊胚 ST7，但在日本和至少一项丹麦研究中也发现了该亚型，因此在其他地区也可以发现致病性ST7。像其他的囊胚菌 一样通过食用受感染动物(包括鸟类)粪便污染的食物来传播ST7亚型。

对于他们报道的研究，研究人员共同孵育了两种分离物(ST7-H和ST7-B)的囊胚 ST7生物与代表性的共生肠道细菌，包括大肠杆菌，粪肠球菌，脆弱拟杆菌，长双歧杆菌，短乳杆菌和枯草芽孢杆菌。。他们的研究结果表明，囊胚 ST7对一些肠道共生细菌有积极作用，并与多种细菌类型的细菌数量增加有关。

然而，当与长双歧杆菌和大肠杆菌共培养时，囊胚 ST7对活性小鼠的胃肠道中的“好”细菌长双歧杆菌的群体产生负面影响，并且还减少了长双歧杆菌的 数量。随后的研究表明，ST7 通过诱导释放活性氧物质的氧化应激机制直接导致双歧杆菌生物的死亡。在大肠杆菌存在下，囊胚 ST7对长双歧杆菌 的不利影响甚至更大。“确实，长双歧杆菌的 基因表达分析他们表示，一些细菌的氧化还原酶基因被上调，这表明它在囊胚和大肠杆菌的存在下正在经历氧化应激，“作者说。“此外，更大百分比的 长双歧杆菌 ，当这些用培养的细胞表现出细胞ROS [活性氧]含量芽 和大肠杆菌。”有趣的是，双歧杆菌和大肠杆菌 是有益的芽 生长。

另外的研究随后发现，通过研究人员尚未发现的机制，囊胚 ST7也在体内减少了乳酸杆菌的 数量 。双歧杆菌和 乳杆菌 通常被认为是良好的细菌，因为它们通过支持衬里细胞之间的紧密连接而起到维持肠内层完整性的作用，并且双歧杆菌也可以具有抗炎特性。这两种细菌也常用作促进肠道健康的益生菌。

除了其上的种群的影响双歧杆菌和乳酸杆菌，芽 ST7被发现，并间接通过触发导致溃疡和肠壁体内的无序结构的炎症反应损伤肠道都直接通过破坏紧密连接蛋白衬里。Tan报道的研究证实，长双歧杆菌 可以保护肠上皮屏障，防止囊胚诱导的损伤。

Tan现在正在开发工具来帮助研究囊胚 可能导致疾病的机制。他的团队开发了一种基因修饰系统，可以在囊胚中引入和表达外源基因 。他们希望利用这个系统阐明囊胚如何 与宿主相互作用引起疾病并探索解决其不利影响的方法。

“据我们所知，这是第一次使用体内系统补充的体外设置来研究囊胚菌 与肠道微生物群的相互作用，”该团队指出。“虽然大多数关于囊胚的报告将其标记为共生菌和健康肠道微生物群的成员，但本研究中的发现表明，由两种致病菌株代表的不同ST囊胚可能与更常见的ST(例如ST1)不同地调节肠道微生物群。 -3)。未来的工作应该包括其他具有较小致病潜力的囊胚 STs以及更多的肠道细菌代表。这应该可以更准确地了解囊胚菌的位置它的STs确实站在肠道健康和疾病上。“