新的eDNA工具研究可帮助科学家发现深海珊瑚

科廷大学的研究人员开发了一种有前途的新工具包，可通过分析从科科斯(基林)群岛沿海水域提取的环境DNA(eDNA)来监测受威胁的珊瑚生态系统。

博士科廷大学分子与生命科学学院珊瑚保护与研究小组的候选人贾森·亚历山大先生说，珊瑚礁系统极易受到人类活动和环境压力的影响，估计有三分之一的珊瑚礁建立，或者scleractinian，珊瑚，在国际自然保护联盟红色名录中被列为高威胁物种。

亚历山大说：“巩膜珊瑚不仅通过为许多其他水下物种提供栖息地和宝贵的食物来源，在海洋生态系统中发挥重要作用;它们还提供重要的服务，例如保护沿海土地免受侵蚀。”

“鉴于珊瑚发挥着非常重要的作用，重要的是，研究人员在分析这些脆弱物种时必须获得准确的生物多样性和监测工具。我们的研究提供了另一种有用的资源，可以追踪这些脆弱和快速变化的生态系统中的珊瑚生物多样性。”

海洋生物学家通常将使用SCUBA进行水下视觉研究来监视珊瑚礁，这可能需要大量劳动力，并且需要很高的专业知识。

为了提供一种更简便的监测珊瑚礁的方法，研究小组探索了eDNA元条形码在评估珊瑚生物多样性方面可能发挥的作用。

利用科廷大学痕迹与环境DNA(TrEnD)实验室的设施，研究人员能够提取，分析和分类从科科斯(基林)群岛的90个经过过滤的地表水样本中获取的遗传物质，这些样本位于距爪哇约1080公里和2100公里处来自西澳大利亚州海岸。

这是eDNA元条形码技术首次用于分析来自印度洋中部太平洋大区域的珊瑚。

“每个水样都经过过滤和冷冻，然后运输到珀斯，在那里提取eDNA并进行测序。然后，在Pawsey超级计算中心使用计算机分析了序列数据，以成功识别出该海洋环境中存在的不同物种。”亚历山大说。

“通过我们的发现，我们能够将水样中存在的不同类型的珊瑚与肉眼观察到的珊瑚进行比较，我们发现eDNA技术与传统的调查技术高度互补。

“通过成功检测地表水eDNA样品中的巩膜珊瑚，这项研究增加了越来越多的证据表明eDNA metabarcoding是检测和研究海洋生物多样性的有前途的方法。”

完整的研究论文“使用eDNA元条形码监测珊瑚多样性的多测定方法的开发”由Coral Reefs发表。

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