流行性痢疾的基因组研究揭示了欧洲如何在全球范围内出口祸害

关于引起流行性痢疾的细菌的最大遗传研究表明，志贺氏痢疾杆菌病原体在非洲和亚洲仍然是一个真正的祸害，可能起源于欧洲。这项研究发表在“ 自然微生物学 ”杂志上，也描绘了病原体对抗生素耐药性的发展。

来自巴黎巴斯德研究所Wellcome Trust Sanger研究所的科学家和国际合作者发现了历史上发生的各种爆发之间迄今未知的联系。在整个18世纪和19世纪，人类遭受最严重的祸害之一，痢疾通过移民运动和军事行动从一个大陆传播到另一个大陆。

细菌志贺氏痢疾杆菌 1型引起危及生命的血性腹泻，并导致数千人死亡，特别是在发展中国家的儿童中。中美洲最后一次大流行在1969年至1972年期间造成2万人死亡。尽管全球痢疾杆菌菌株被隔离，但每种痢疾流行病的起源及其之间的联系仍不清楚。

为了详细了解这种疾病，由Wellcome Trust Sanger研究所的Nicholas Thomson教授和巴斯德研究所的资深作者François-Xavier Weill博士领导的科学家团队利用高通量技术进行细菌基因组测序的大型基因组研究。和生物信息学。他们分析了1915年(参加第一次世界大战加利波利运动的士兵)和2011年分离出的330多株痢疾志贺氏菌。这些菌株已被66个国家的35个国际研究所收集。

研究小组发现，1型菌株至少在18世纪就存在，并在全球范围内传播。与普遍看法相反，该研究表明，目前非洲和亚洲流行的痢疾志贺氏菌病原体来自欧洲。

桑格研究所细菌基因组学和进化组的负责人Nicholas Thomson教授说：“分析在很长一段时间内收集的所有这些志贺氏痢疾杆菌菌株的全基因组，以及来自不同国家的这些菌株，为我们提供了前所未有的洞察力。这种病原体的历史传播。这是必要的，因为关于这种臭名昭着的重要细菌病原体仍有许多未解答的问题。它是通过将高分辨率基因组研究数据与记录大量来自每个样本的来源的详细信息相结合而实现的。专门团体。“

通过鉴定不同的遗传谱系，科学家能够追踪全球细菌的路径，表明欧洲殖民主义和迁移有助于传播病原体。

欧洲痢疾杆菌在1889年至1903年间传播到美洲，非洲和亚洲，得益于欧洲移民到美国以及非洲和亚洲领土的殖民化。在第一次和第二次世界大战期间，这种细菌再次出现在欧洲，然后在欧洲消失。然而，它继续在亚洲，非洲和中美洲蔓延，暴力爆发，随后几次流行病从印度次大陆蔓延到非洲和东南亚。

由于第一批细菌在使用抗生素之前已被很好地分离出来，因此对该系列的研究表明，在20世纪60年代中期，亚洲和美国首次出现抗生素耐药性。然后，这种细菌获得了针对大多数抗生素的抗性基因 - 自20世纪90年代以来，不到1%的细菌菌株仍然对抗生素敏感。科学家认为这是不可避免的，并引起人们担心痢疾细菌会对最后的抗生素类产生抗药性。

巴斯德研究所肠道细菌病原体研究室主任François-Xavier Weill博士说：“这种细菌仍处于流通状态，如果条件证明有利，可能会对未来的流行病负责 - 例如大量无法进入的人群该研究强调了对有效疫苗的需求，鉴于抗生素的疗效降低，这对于今后控制这种疾病至关重要。

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