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DNA梯子用于DNA研究的廉价分子标尺

新的免许可DNA梯子将允许研究人员估算DNA片段的大小,而成本仅为现有方法的一小部分。由宾夕法尼亚州立大学生物化学与分子生物学教授Song Tan和前大学生Ryan C. Henrici领导的本科生研究小组开发了两种质粒 - 一种圆形DNA - 可用DNA剪刀切割,称为限制酶,以创造DNA梯子。梯子可用于估计长度在约50和5,000个碱基对之间的DNA片段的大小。2017年5月26日在科学报告期刊上发表了一篇描述该研究的论文。

DNA梯子用于DNA研究的廉价分子标尺

“DNA梯子,也称为DNA分子量标记,是分子生物学研究中最常用的试剂之一,”Tan说。“它们用于任何需要凝胶电泳的应用 - 一种根据DNA大小分离DNA片段的技术。我们希望将这些质粒提供给研究界,以便以低成本生产高质量的DNA分子量标记物。 “

研究小组创建了两种质粒pPSU1和pPSU2,它们共同产生DNA梯子,增量为100或1,000碱基对,具体取决于使用的限制酶。研究人员可以在他们自己的实验室中轻松地生产足够的两个梯子,以低于10美元的价格进行1,000次使用。相比之下,商业上可获得的DNA梯子价格在250美元到500美元之间。此外,与许多目前可用的DNA梯子不同,100碱基对梯子适用于琼脂糖和聚丙烯酰胺凝胶,这两种类型通常用于分子生物学。

“我们也很高兴pPSU质粒可能在全球范围内用于进一步研究和加强课堂实验室的科学教育,”Henrici说。“这项技术每次使用的DNA梯度不到一美分,是使用商用DNA梯子的一小部分。”

用于生产宾夕法尼亚州立大学DNA梯子的pPSU1和pPSU2质粒将通过Addgene和DNASU质粒库获得非营利性学术用户的许可限制。

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