肠道微生物组可能为IBD治疗成功的可能性提供线索

根据一项早期研究，IBD患者微生物组的构成可能有助于预测治疗性抗体治疗是否会证明富有成效。

治疗炎症性肠病(IBD)，如溃疡性结肠炎(UC)和克罗恩病(CD)，目前是一个反复试验的过程。尝试一种治疗，寻找反应。如果患者没有改善，请尝试下一次治疗。然后是下一个。虽然研究人员已经尝试开发使用患者临床特征或遗传学的预测工具，以帮助医生更快地进行最有益的治疗，但尚未证实这些工具的稳健性或准确性足以被广泛使用。

今天在Cell Host和Microbe报道的一项研究中，Ashwin Ananthakrishnan(马萨诸塞州综合医院的胃肠病学家)，Chengwei Luo，Ramnik Xavier及其同事开始探索患者的微生物组是否可以保留能够提供他们所寻求的预测能力的标记物。。

研究小组研究了接受维多珠单抗(一种抑制肠道炎症的抗体)的85名IBD患者的肠道微生物组谱，测量了开始治疗前和多个时间点采集的样本中的物种组成和微生物活动。然后他们将这些概况与患者的反应进行比较。

数据产生了一些令人惊讶的模式。那些在治疗14周后IBD症状消失的患者在治疗开始时更有可能在肠道内携带特定种类的细菌。特别是，对治疗有反应的CD患者携带更高水平的Roseburia inulinivorans和Burkholderiales物种 - 并且在治疗前其肠道中的细菌群落总体上比没有反应的患者更多样化。

然而，更有趣的是，微生物正在做的事情是治疗成功的更强预测因素，而不仅仅是微生物的身份。研究小组确定了13种代谢途径，这些途径在进入缓解期的CD患者的肠道细菌中更为活跃，包括产生被认为可减轻炎症的分子的途径。

为了评估概况的预测价值，该团队将他们的数据输入基于神经网络的机器学习工具vedoNET，并将其结果与患者的经验进行比较。在使用患者的临床信息，物种水平和途径数据时，该工具产生了最准确的预测。

虽然该团队指出该研究需要与更多的患者群体重复进行，并且在其他治疗的背景下，他们的研究结果表明，随着临床测序变得越来越普遍，筛查IBD患者的肠道菌群并使用这些数据应该是可行的。指导治疗决定。

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