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研究人员在DNA中发现了隐藏的线索

2019-05-16 09:51:04 • 来源：

曾经想知道土壤是什么?亚马逊热带雨林的土壤真的可以和你花园里的土壤一样吗?荷兰生态研究所(NIOO-KNAW)和英国曼彻斯特大学的研究人员正在利用DNA测序解锁世界不同土壤的秘密，并首次在全球范围内分析生态模式和微生物群落。

研究人员在DNA中发现了隐藏的线索

该研究小组由来自世界各地的36位科学家组成，整理并分析了来自21个不同国家的土壤细菌数据。他们总共看了1900多个土壤，含有8000多个细菌群。

该研究发表在今天的“自然微生物学”杂志上，为使土壤成为土壤的细菌，以及土壤如何发挥作用以及应对气候变化等全球挑战提供了新的见解。

研究发现，无论从地球上收集的细菌，一些细菌群体总会出现在土壤中。无论是在英国还是在亚马逊热带雨林的森林中，它们都是不变的。但其他细菌更挑剔，研究人员应该注意这些细菌。这是因为这些细菌可以提供线索，使得一些土壤比其他土壤更肥沃，更适合种植作物。

来自NIOO-KNAW的Kelly Ramirez博士解释说：“当我们看到仙人掌时，我们知道我们在沙漠中，当我们看到一棵棕榈树时，我们知道我们在热带地区，当我们看到一棵草时，我们几乎可以同样的想法，这个物种表明一个栖息地，对于土壤是真实的，但是我们使用土壤细菌而不是使用植物。但是如果你要从你的花园，森林，甚至草地上捡起一些土壤它可能很难区分出来。“

然而，生活在世界土壤中的微生物群落更加多样化，包含的个体比地球上任何其他物种群体都多，并且可以告诉我们很多关于它们的起源。

来自曼彻斯特大学地球与环境科学学院(SEES)的Franciska de Vries博士补充道：“在土壤中，这些细菌有助于植物生长，循环碳并保持我们的生态系统正常运转。世界各地的科学家正在研究这些重要细菌但是他们都在使用不同的技术并且保持所有信息的组织是一项挑战。所以我们决定尝试找到一种方法来巩固所有的研究并将它们整合在一起。“

那时，来自SEES和该论文的共同作者的Chris Knight博士也将他的专业知识带到了这项研究中。他是微生物和计算机建模方面的专家，他使用了一种可以容纳数千种细菌的特定技术。“机器学习”方法允许团队评估所有物种，并将它们与不同的环境因素相互匹配。

奈特博士补充道：“结果是对特定细菌群在塑造土壤细菌群落中的作用有了新的更清晰的认识。有些细菌很常见，但在任何特定土壤中出现的细菌多与细节有关。它们是如何被测量的，而不是土壤中的任何真正的差异。有些是非常罕见的，你只能在少数几种土壤中看到它们，这并没有多少说明。但在两者之间有细节的细菌家族，表明真正的差异在各种土壤中。“

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