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阿拉伯羚羊基因组序列草案

2018-12-10 16:34:04 • 来源：

卡塔尔的研究人员绘制了脆弱的阿拉伯羚羊的基因组图谱。这种羚羊的角矛类似，它在动物园和自然保护区中幸存下来，在20世纪70年代被列为灭绝之后。2011年，经过圈养育种计划将该物种从边缘带回来后，它仅被国际自然保护联盟重新归类为“易受伤害”。

保护主义者和研究人员希望更好地了解现存羚羊种群的遗传多样性，因为羚羊之间数十年的密集杂交已经缩小了遗传多样性并威胁了物种的长期生存。

在这项研究中测序的基因组是从保存在卡塔尔Al Wabra野生动物保护区的年轻雄性动物中检索出来的，证实了环保主义者对遗传多样性确实非常低的担忧。

在多哈的卡塔尔威尔康奈尔医学院开展这项工作的首席遗传学家乔尔·马利克(Joel Malek)警告说，观察到的低遗传多样性可能只在Al Wabra野生动物保护区的圈养人群中很明显。唯一可靠的方法是对来自其他圈养种群的基因组进行测序。

“这当然是我们的下一步，”马利克说。他希望从不同的畜群开始测序至少5-10个羚羊，以更好地了解遗传现状。然而，使第一次基因组作图特别具有挑战性的是缺乏任何羚羊基因组参考。

“这是一个从头的序列和装配，需要特殊的DNA库和相当大的计算基础设施，”他说。由于它们具有动物基因组的粗略草图，因此对其他羚羊的基因组进行测序将更加容易和便宜。虽然第一次测序成本约为300,000美元，但进一步的测序费用仅为10,000美元。

“我们希望尽快开始对它们进行排序，但我们正等待有关各方的资助，”Malek补充道。

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