新发现的一类分子可能会促进癌症疫苗的开发

癌症疫苗旨在提高免疫系统对肿瘤独特功能的认识，提高其识别，攻击和摧毁癌症的能力。迄今为止，有效的癌症疫苗已经集中于所谓的“新抗原”，即由获得性突变引起的肿瘤特异性肽。但并非每种肿瘤都会产生免疫系统可识别的不同抗原。因此，目前的癌症疫苗不适用于所有患者。

现在，由广泛癌症计划实验室研究员和Dana-Farber癌症研究所肿瘤学家Eliezer Van Allen领导的研究小组展示了一种全新的新抗原。这项新研究发表在Nature Biotechnology上，由医学院学生Alicia Smart和计算生物学家Claire Margolis领导。

被称为“保留的内含子新抗原”，这些潜在的免疫触发源于基因中称为内含子的非编码DNA的短片段 - 当基因被翻译成蛋白质时，这些片段通常被拼接出来。然而，在癌症中，内含子通常被翻译成基因的最终蛋白质产物。

该团队开发并应用了一种算法，该算法可以识别48名黑色素瘤患者的这些残留内含子，这些患者接受过一种称为检查点抑制剂的癌症免疫治疗。通过在其分析中包含保留的内含子，该团队将他们可识别的新抗原数量大致翻了一番。他们发现，这些新肽与称为MHC I类的分子结合，这是免疫系统识别的第一步。

研究小组还研究了检查点抑制剂治疗 - 一种增加总体免疫活性但不针对特定新抗原的治疗 - 在保留内含子新抗原数量增加的肿瘤中更为成功。有趣的是，他们发现保留更多的内含子新抗原并没有带来更好的治疗效果，这与Van Allen和其他人之前的工作形成鲜明对比，后者显示获得性突变新抗原的总数与更好的免疫治疗反应之间存在正相关关系。

研究人员还发现，对检查点抑制剂无反应的肿瘤以及具有高水平保留的内含子新抗原的肿瘤均显示细胞周期调节基因的上调。靶向这些相同基因的药物可以增加检查点抑制剂的有效性，表明保留的内含子新抗原的存在与潜在有效的组合疗法之间存在诱人的可能联系。

研究人员指出，这种联系需要进行大量的进一步调查。与此同时，他们还计划专注于确定用于开发癌症疫苗的其他新的新抗原类别。

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